由Nature Research编制，依托于全球顶级82个期刊高质量科学期刊独立选出的研究论文中整理出来的数据库，统计各高校、科研院所（国家）在国际上最具影响力的研究型学术期刊上发表论文数量。
自然指数每月更新一次，2018年度数据可在Nature Index官网上公开获取。自然指数还发布了回溯至2015年的国家和机构日历年度产出的年度表格，以及前几年发布的年度表格的存档。
- 两个指标：
文章计数（AC）：如果研究文章的一个或多个作者来自该机构或国家，则将一个计数分配给一个机构或国家，无论该机构或国家之外有多少共同作者。
分数计数（FC）：考虑该机构（或国家）的作者百分比和每篇文章的附属机构数量。对于FC的计算，所有作者都被认为对该文章做出了同样的贡献。任何文章的最大组合FC为1.0。
AC与FC的比率表明机构或国家在其研究中的合作程度。从广义上讲，如果AC比FC高很多，则表明高度的外部协作和对外部资源的依赖。如果AC与FC的价值接近，则表明与外部研究人员的合作有限，并且对内部资源的依赖性很大。
- 指数目的：
在自然指数关注的高质量科学研究中，研究机构有多少产出
研究机构与世界、本地区、本领域其他机构横向比较情况如何
哪些机构对全球、本地区、本领域的自然指数所追踪的高质量科学研究做出了最大的贡献
哪些机构和国家在高质量的研究中相互合作，他们合作的力度是什么，以及这种情况如何随着时间而变化？
自然指数还将为机构提供一种简便的方法来标识他们一些最佳的研究。
自然指数通过已发表论文来分析高质量的研究，旨在成为评估卓越研究和机构绩效的众多指标之一。不具有唯一性，需同其他评价和工具共同使用.
备注：
自然出版指数(nature publishing index)是以国际知名学术出版机构英国自然出版集团的《自然》系列期刊在前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。本指数于2016年1月停止更新。
参考：
