量子化学软件大全

2018年7月18日19:15:54量子化学软件大全已关闭评论 571 views

ABCRATE

主页:http://comp.chem.umn.edu/abcrate/

获得方法:填写申请表,发传真,得到下载账号和密码。

简介:用广义过渡态理论(GTST)计算原子-双原子分子通过线性反应路径进行反应的程序。程序需要用户提供内坐标,返回该几何结构的势能和梯度。所有的振动能级都是量子化的,非谐性可以有几种选项,包括用于拉伸的Morse和Wentzel-Kramers-Brillouin (WKB)非谐性,用于弯曲的四级和离心谐振子非谐性。传播因子可以解决势垒贯穿,并可包含非经典反射。传播因子可用的方法有:半经典绝热基态能量最小路径方法(MEPSAG,也称作ZCT),半经典绝热基态离心小弯曲方法(CD-SCSAG,也称作SCT),基态大弯曲方法-第三版(LCG3,也称作LCT),基态最小反应方法(LAG,也称作LAT),以及微正则优化多维势垒贯穿方法(muOMT)。通过平衡还能确定逆反应率。

功能:(见上)

相关软件:(无)

***ABINIT

主页:http://www.abinit.org/

获得方法:直接下载。(见下)推荐注册。

简介:一个最大的特点,就是基组库囊括了元素周期表1-109号所有元素。而其它量化软件不提供超重元素的基组。元素的基组要单独下载。

功能:
可以计算很多物理属性:
A. 计算核与电子的总能量。
A.1. 计算使用平面波和赝势。
A.2. 总能量的计算使用密度泛函理论(DFT)。可以使用大多数重要的局域密度近似 (LDA),包括Perdew-Zunger近似。可以使用两种不同的局域自旋密度(LSD),包括Perdew Wang 92和M. Teter的LSD。还可以使用Perdew-Burke-Ernzerhof GGA (极化和非极化自旋)。
A.3. 自恰场计算生成DFT基态,以及相关的能量和密度。
A.4. 程序可以使用多种不同的赝势。对整个周期表适用的有两种:Troullier-Martins型和Goedecker型(这种类型包括自旋-轨道藕合)。如果需要的话,程序本身还可以产生新的赝势。
A.5. 程序本身可以处理金属和绝缘体系。

A.6. 单元可以是正交或者非正交。
A.7. 电子体系可以用自旋极化和自旋非极化计算。
A.8. 总能量,力,电子结构的计算可以考虑自旋-轨道藕合。
A.9. 离解能。
B. 计算总能量
B.1. 计算Hellman-Feynman力。
B.2. 计算应力。
B.3. 极化的计算。
B.4. 响应的计算。
B.5. 计算近似的和准确的磁化系数矩阵和介电矩阵。
B.6. 可以用TDDFT计算原子、分子的激发态能量(单重态和三重态)。
C. 移动原子,改变单元参数
C.1. 寻找平衡构型。
C.2. 分子动力学计算。
C.3. 自动分析键长键角。原子坐标的格式支持用可视化软件XMOL显示。
D. 图形工具
D.1. 键结构(用XMGR显示)
D.2. 不同参数的总能量(用XMGR显示)
D.3. 电荷密度(3D轮廓线)

平台:各类Unix/Linux,Win98/Dos

相关软件:

*** fhi98PP

简介:赝势基组生成程序。

地址:http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/fhi98md/fhi98PP/index.html

获得方法:直接下载。
http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/fhi98md/download/index.html#fhipp

ACRES

主页:http://cst-www.nrl.navy.mil/~singh/acres/info.html

获得方法:与作者U. V. Waghmare联系

简介:ACRES是密度泛函理论(DFT)代码,用于在并行机上进行原子、分子、固体和表面的总能量计算。

功能:(见上)

平台:CM-5,IBM SP2和ORIGIN 2000

相关软件:(无)

***AIM2000

主页:http://gauss.fh-bielefeld.de/aim2000

获得方法:在线注册,获得下载的账号和密码。

简介:图形界面软件。用于显示分子中原子的属性。

功能:(见上)

平台:Win98

相关软件:(无)

AllChem

主页:http://www.theochem.uni-hannover.de/AllChem/

获得方法:不详

简介:基于Kohn-Sham方法的从头计算LCGTO-DFT程序。

功能:
各种库仑积分展开
xc能量和势的数值积分
SCF程序
几何优化,寻找过渡态
频率分析
特性分析

平台:各类Unix/Linux,Windows95

相关软件:(无)

***AMICA

主页:http://gdanitz.hec.utah.edu/amica/

获得方法:填写注册单后下载,或者直接下载
http://www-public.tu-bs.de:8080/~gdanitz/amica.tar.gz

简介:
对一般的开壳层和多重参考情况,使用Kutzelnigg和Klopper的r12方法,包括r12-MR-CI和r12-MR-ACPF,已用于COLUMBUS的套件MR-CI中。

功能:类似于COLUMBUS。

相关软件:(无)

AMMP

主页:http://www.cs.gsu.edu/~cscrwh/ammp/ammp.html

获得方法:直接下载。

简介:AMMP是分子力学,动力学和模型程序。它既可以计算小分子,也可以计算蛋白质、核酸、聚合物等巨型分子。AMMP包含密度泛函理论。除了具有其它一些分子力学程序都有的标准功能外,它还可以很容易地引入非标准聚合物链,反常配合物和非标准基,并有添加丢失的氢原子,以及完成局部结构的功能。

功能:(见上)

平台:Unix/linux Windows 95/98/NT

相关软件:(无)

***AMPAC 2.3

主页:http://galileo.pace.edu/cgi-bin/wrap/athanaso/Miscellaneous/

获得方法:直接下载。

简介:这可不是商业软件AMPAC。可以做半经验计算。

功能:(见上)

平台:Windows

相关软件:(无)

AMSOL

主页:http://comp.chem.umn.edu/amsol/

获得方法:填写申请表,发传真,得到下载账号和密码。

简介:AMSOL是半经验量子化学程序,包括MINDO/3,MNDO,AM1和PM3气相哈密顿量,CM1A,CM1P,CM2/AM1和CM2/PM3电荷模型用于计算局部原子电荷,SM1至SM5.42R溶液模型用于计算水溶液中的自由能,SM4溶液模型用于计算烷烃溶液中的自由能,SM5.42R,SM5.4,SM5.2R和SM5.0R溶液模型用于计算任何有机溶剂中的自由能。大多数溶液模型基于AM1和/或PM3哈密顿量,SM5.2R模型还用到了MNDO哈密顿量。AMSOL还接受用户指定的特殊反应参数。所有名称标注“R”的溶液模型用于刚性溶质计算,利用精确的气相结构预测溶液的自由能。对所有的其它模型,几何优化可用与气相和溶液。对于SM5.4模型分析导数可用于几何优化。

功能:(见上)

相关软件:(无)

AOMX

主页:http://www.theochem.uni-duesseldorf.de/users/heribert/aomx/

获得方法:给作者发email。

简介:AOMX是计算电子谱项的FORTRAN程序,它基于包含电子相互作用和自旋-轨道藕合的重叠角模型。主页提供在线计算。

功能:(见上)

相关软件:(无)

***ArgusLab 3.0

主页:http://www.planaria-software.com/

获得方法:在线填写注册单后下载。

简介:
功能和界面类似于商业量化软件HyperChem。

功能:
1. 交互式构造三维分子模型。
2. 计算类型:单点能,几何优化,电子激发光谱,电子光谱的自恰反应场(SCRF)溶剂模型。
3. 分子特性。
4. 分子力学。
5. 量子力学:整个周期表的扩展休克尔方法,MNDO、AM1、INDO1/s、PM3等半经验方法,限制和非限制Hartree-Fock SCF,用于激发态的ZINDO半经验哈密顿量,MNDO,AM1和PM3的生成热。

平台:Windows 95/98,Windows NT 4.0,Windows 2000,Windows XP

相关软件:(无)

ASW

主页:http://www.physik.uni-augsburg.de/~eyert/aswhome.shtml

获得方法:联系Volker Eyert (email: eyert@physik.uni-augsburg.de)

简介:扩展球面波方法(Augmented Spherical Wave Method)代码。ASW基于波恩—奥本海默近似,用Fortran95编写。密度泛函理论使用局域密度近似(LDA,使用多种参数),广义梯度近似(GGA,包括Perdew-Wang 1991, Engel-Vosko 1993, Perdew-Burke-Ernzerhof 1996) ,松饼罐头近似(MTA)–>原子球近似(ASA) 。它覆盖整个周期表的元素,用于计算金属,半导体和绝缘体。

功能:可以进行标量相对论计算,自旋限制和自旋非限制计算。可以计算电子特性,磁特性,凝聚性和弹性,化学键等。

平台:Windows95/98/NT Unix/PC Linux

相关软件:(无)

***atompaw & pwpaw

主页:http://www.wfu.edu/~natalie/papers/pwpaw/man.html

获得方法:直接下载。

简介:投影波放大(PAW)代码,用于计算电子结构。

功能:
atompaw程序机遇PAW方法产生用于电子结构计算的投影和基函数,使用与周期表中所有的原子。用户只需按照pwpaw代码识别的格式输入原子序数,电子组态,选择的基函数以及相应的矩阵元素。pwpaw是平面波PAW工具,用于密度泛函理论的电子结构计算。除了对周期性固体的电子结构进行自恰场计算之外,pwpaw还有其它功能,包括基于波恩-奥本海默近似的几何优化和分子动力学模拟。

平台:Unix/linux

相关软件:(无)

atsp

主页:http://www-cfadc.phy.ornl.gov/data_and_codes/cff/home.html

获得方法:直接下载。

简介:MCHF近似的原子结构代码。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

***Babel

主页:http://smog.com/chem/babel/

获得方法:直接下载。

简介:Babel转换分子模型格式的程序。

功能:
Babel可以读取的文件格式有:Alchemy,AMBER,CADPAC,Chem3D,GAMESS,Gaussian,Hyperchem,Isis,Mopac,PC Model,PDB,Spartan,UniChem等。
Babel可以书写的文件格式有:Alchemy,Chem3D,ChemDraw,Gamess,Gaussian,Hyperchem,Mopac,PC Model,PDB,Spartan,UniChem等。

平台:Unix (AIX, Ultrix, Sun-OS, Convex, SGI, Cray, Linux), MS-DOS和Macs。

相关软件:

***Babel-i

主页:http://pro122lin.chemie.hu-berlin.de/wessig/software/babel_i.html

获得方法:直接下载。

简介:Babel-i是图形界面的Babel程序,内含Babel 1.6。

平台:Windows。

***BabelWin

主页:http://www.msi.umn.edu/user_support/tutorials/mol_vis/babel/

获得方法:直接下载。http://www.ccl.net/cca/software/MS-WIN95-NT/babel/index.shtml

简介:图形界面的Babel程序。

平台:Windows。

***BICON-CEDiT

主页:http://iacrs1.unibe.ch/program/biconcedit.html

获得方法:直接下载。

简介:休克尔分子轨道和谐振强度计算软件。

功能:(见上)

平台:各类Unix/Linux,Windows

相关软件:(无)

CADPAC

主页:http://www-theor.ch.cam.ac.uk/software/cadpac.html

获得方法:直接下载(只有可执行文件,不提供源代码)。

简介:(见下)

功能:
s,p,d和f基函数。对过渡元素可使用赝势。
限于1000个基函数和100个原子(有些方法限于255个基函数)
自恰场(SCF)计算
1. RHF,ROHF,UHF和GRHF自恰场类型。
2. 所有SCF类型的分析梯度。
3. RHF,ROHF和GRHF的分析力常数。UHF的数值力常数。
4. 定位固定点(最小值和过渡结构)。
5. 多极矩,分布式多极分析,极化率,磁化率,NMR屏蔽常数,红外强度,拉曼强度,VCD强度,函频率极化率和超极化率,激发能,散射系数,外场影响,场梯度和栅格等特性计算。其中有些特性计算仅用于闭壳层系统。
Mфller-Plesset Calculations
1. 闭壳层和开壳层体系的能量和梯度。开壳层体系还可使用UHF或ROHF。能量可用于MP2,MP3和MP4,梯度只能用于MP2和MP3。
2. 闭壳层MP2可以计算分析力常数,偶极矩导数和极化率,开壳层MP2的力常数使用有限差。
3. 几何优化,等。
4. 特性:电荷,多极矩和极化率。
其它有关计算
1. 闭壳层能量计算:CISD,CEPA,ACPF,QCISD,QCISD(T),CCD,BD和BD(T)。
2. BD和BD(T)的分析梯度。
密度泛函理论
1. 可以使用LAD和非局域泛函(B-LYP,B-P86,B-P91),以及各种混合泛函(如B3LYP和B3P91)。
2. 可进行几何优化,极化率,红外强度,磁特性(NMR屏蔽),力常数等计算。
最近添加的功能
1. 分子间微扰理论(IMPT)。
2. 数值积分计算分布式多极矩和极化率。
3. LeSueur-Stone算法进行分布式极化率计算。
4. DFT的含频极化率。
5. DFT进行激发能计算。
6. 加入HCTH,B97-1,PBE和PBE0泛函。
7. DFT计算激发态的梯度。

平台:Silicon Graphics R10000 Irix 6.5,Compaq/DEC,IBM Power3 AIX 4.3

相关软件:(无)

***Car Parrinello

主页:http://www.cineca.it/~acv0/CP/carpar.html

获得方法:直接下载。http://www.cineca.it/~acv0/CP/

简介:执行标量Car-Parrinello算法的程序。该代码原是为1997年在ICTP (Trieste Italy)“计算物理春季大学”准备的演示工具,但是功能相当完整。还能进行密度泛函计算。

功能:(见上)

平台:Intel/Linux,SGI/Irix,IBM/AIX,Alpha Digital/ Digital Unix

相关软件:(无)

cart

主页:http://www.lcp.u-psud.fr/Pageperso/lauvergnat/cart/cart.html

获得方法:直接下载。

简介:类似于Babel,可以进行不同量化程序间几何结构转换。同时还有计算键长,键角,Z-矩阵,添加虚原子等功能。

功能:
读取Gaussian92,monstergauss (一个很老的从头计算程序),exthuc (扩展Hückel),ampac,gamess,molpro笛卡尔坐标
对xmol,rasmol,molecule,chem3d和molplt写笛卡尔坐标
读取Z-矩阵
计算转动常数

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

CASINO

主页:http://www.gel.usherb.ca/casino/

获得方法:直接下载。

简介:固体电子轨迹蒙特卡罗模拟程序,简单易用的图形用户界面。

功能:
可以模拟出扫描电子显微镜的理论信号,模拟电子与固体的作用,计算X光和背景散射电子。

平台:Windows

相关软件:(无)

***CASTEP/CETEP/VASP

主页:http://www.cmmp.ucl.ac.uk/~lev/codes/lev00/

获得方法:直接下载。

简介:平面波DFT代码。

功能:(见上)

相关软件:(无)

***Chem2PAC

主页:http://www.ifi.unicamp.br/gsonm/chem2pac

获得方法:直接下载,免费注册。未注册的有使用时间限制。

简介:图形界面。内含MOPAC,能进行半经验计算。

功能:
1. MOPAC 6(两个,分别对于50个重原子和100个重原子);
2. RasMol 2.6.4(用于描述分子);
3. Babel 1.6(用于转换文件格式);
4. ExamDiff(用于比较文本文件);
5. Mol2Pov(使用自由软件PovRay生成精美的分子图形)。

平台:Windows

相关软件:(无)

***CIPSI-Pisa & HONDO95

主页:http://www.dcci.unipi.it/~mau/cipsi.htm

获得方法:直接下载。
http://www.dcci.unipi.it/~mau/cipsi/download.htm
同时提供HONDO95下载。

简介:CIPSI-Pisa是零级波函多重参考微扰组态相关软件包。它基于电子相关的多重参考微扰处理,用于计算电子能量,波函和特性。CIPSI-Pisa需要分子轨道和相应的单电子、双电子积分文件,可从HONDO95代码(从头计算程序,M. Dupuis,IBM公司)中生成。

功能:
通过行列式基对角化确定零级波函和能量,行列式典型的维数是1-100000。
通过转动修正零级波函,产生准-非绝热态。
使用Mφller-Plesset和的CI哈密顿量,进行瑞利-薛定谔微扰理论计算。零级空间行列式的所有单、双激发都被考虑。或者在微扰步骤中只有总零级空间的子空间产生激发。
进行准简并微扰理论计算。
微扰步骤中使用快速图表方法,代替经典的单行列式总和方法。
可以计算零级和一级微扰密度矩阵,单电子特性和跃迁矩阵元素。
计算自旋-轨道藕合和非绝热藕合。

平台:Linux/Unix

相关软件:(无)

CNDO 4.0

主页:http://wgc.chem.pu.ru/~valera/cndo/manual.html

获得方法:在线填写注册单后下载。

简介:Cndo 4.0是使用半经验哈密顿量计算晶体电子结构的程序(使用价键理论模型)。

功能:(见上)

平台:OS/2,UNIX,DOS/Windows

相关软件:

*** CrystalValency

主页:http://wgc.chem.pu.ru/~valera/cndo/br.htm

获得方法:直接下载。
http://wgc.chem.pu.ru/~valera/cndo/brown.zip

功能:检查晶体结构,原子间距离,并进行晶体化合价的计算。

平台:DOS/Windows

***COLUMBUS

主页:http://www.itc.univie.ac.at/~hans/Columbus/columbus.html

获得方法:同时传真或邮寄COLUMBUS和DALTON的申请给COLUMBUS的作者就能成为正式用户。但是不注册也能下载。
ftp://ftp.itc.univie.ac.at/pub/quant/COLUMBUS/

简介:
COLUMBUS是一套高级的分子电子结构从头计算程序。设计这个程序最初是为了对原子、分子的基态和激发态做计算多重参考(MR)计算。COLUMBUS目前已包括多种方法。它本身还包含了免费软件Molden,可以在X-window下用图形显示计算结果。

功能:
RHF和ROHF SCF代码
态平均MCSCF
标准MR-CISD,包括尺寸扩展修正方法MR-CISD+Q, MR-AQCC, MR-AQCC/LRT及相关方法
在MCSCF, MR-CISD和MR-AQCC 理论级别上进行几何分析和鞍点优化
从分析梯度进行数值哈密顿频率和力常数计算
MCSCF, MR-CISD和MR-AQCC/LRT理论级别上的跃迁密度和跃迁矩
COLUMBUS自带可视化程序Molden,且无需另外安装。用于在X窗口中图形显示COLUMBUS计算结果。

相关软件:(无)

资源:COLUMBUS5.7简易安装和使用说明(中文)
COLUMBUS5.7版中文说明(译自COLUMBUS5.7的README文件)

注意:安装前不需要解压缩那些.tar和.tar.gz文件。安装方法见以上说明。

CP2K

主页:http://www.cscs.ch/projects/CP2K/News/

获得方法:直接下载。

简介:用于固态、液体、分子和生物体系的原子和分子模拟。方法包括从第一定律密度泛函方法,到参量化经典双体、多体势。使用的交换-相关泛含有:
交换部分:Slater, VWN, Pade; Becke88, Perdew86, PBE
相关部分:VWN, Pade; LYP, Perdew86, PBE
其中自旋极化只用于Becke88。

功能:(见上)

平台:Linux/Unix

相关软件:(无)

CRUNCH

主页:http://phy-ggallup.unl.edu/crunch/

获得方法:直接下载。

简介:CRUNCH可以对分子体系执行从头价键计算,以及RHF,ROHF,MCSCF和MOCI处理。

功能:
用RHF,ROHF,UHF(+MP2),MCSCF,正交CI和MCVB方法进行结构和能量计算。
在RHF,ROHF,UHF,MCSCF,VB之后进行偶极矩和四级矩计算。

平台:LINUX,AIX,IRIS和HPUX,但不能运行在XENIX和SCO-UNIX上。

相关软件:(无)

***DACAPO

主页:http://www.fysik.dtu.dk/CAMP/dacapo.html

获得方法:直接下载。
http://www.fysik.dtu.dk/CAMP/CAMPOS_access.html

简介:
DAPACO是基于密度泛函理论计算总量的程序。它对价电子态使用平面波基组,用Vanderbilt ultrasoft赝势描述核-电子间相互作用。程序对局域密度近似(LDA)和各种广义梯度近似(GGA)交换势使用态-ART迭代算法进行自恰计算。程序可以进行分子的动力学/结构驰豫,同时在密度泛函理论内解薛定谔方程。支持多种硬件平台,即可进行并行又可进行串行计算。
程序的代码现在已经从Fortran77升级到Fortran90。当前版本由简单易用的Python工具外部控制。

功能:(见上)

相关软件:(无)

***Dalton

主页:http://www.kjemi.uio.no/software/dalton/ 和http://www.sdsc.edu/dalton/dalton.html

获得方法:传真或邮寄申请,获得账号和密码后就可以下载。

简介:
Dalton量化软件包功能十分强大,用SCF,MP2或MCSCF波函计算分子的特性,其中主要在于磁特性和(含频率的)电特性领域。以及用来研究分子的势能曲面。
Dalton和另一个免费的量化软件DIRAC的输入文件结构基本是类似的。Dalton的部分功能包含在COLUMBUS中,用作分子坐标输入工具。
Dalton目前可用的版本尚不包含密度泛函理论。包含DFT的Dalton正在测试中。最近新推出了1.2版,增加了以下功能:1. 藕合簇;2. 非平衡溶剂;3. 二级偏振传播近似(SOPPA);4. 组态态函数(CSF);5. 原子平均场近似(AMFI);6. 有效核势(ECP);7. Douglas-Kroll标量相对论哈密顿量;8. 线性藕合模块;9. 振动平均;10. 磁的圆二色性;11. 双光子吸收;12. 溶剂几何优化;13. 文件分割;14. RESPONSE模块的重新计算功能;15. 增加了计算结果可视化工具

功能:
普通特性
一级和二级几何优化
寻找过渡态的二级方法
限定的几何优化
普通数值导数
SCF代码
到可视化程序的界面 (GAMESS,Molden和VRML)
有效核势
分子积分
矢量化和并行积分代码
使用笛卡尔和球高斯基组
任意角动量的基组
可以操纵片断和普通收缩基组
容易扩充的大基组库
允许用户输入基组
支持EMSL基组库
探测完全点群对称性,使用D2h 和其子群
可以计算所有标准的单、双电子积分
P-超级矩阵
非标准的单、双电子积分列表:
单、双电子自旋-轨道积分
任意级别的多重积分
完全和顺磁自旋-轨道积分
Fermi-接触和自旋-偶极积分
实数值和虚数值单电子积分
波函
RHF和开壳层ROHF
推广休克尔或核哈密顿量起始轨道
DIIS,Roothaan或二次收敛方法
自动的Hartree-Fock占据
完全的和固定的 (QC) 完全活性空间 (CAS)或限制活性空间(RAS)波函
组态态函数(CSF)或行列式基
激发态和核孔
完全组态相关代码
几个藕合簇波函
SCF/MCSCF分子特性
线性(单重/三重),二次(单重/三重),和立方(单重)含频率响应特性
线性二级极化传播近似 (SOPPA)
双-、三-光子过程
NMR特性
圆二色性特性(ECD,VCD,ROA)
测量起始独立的磁特性
直接动力学
溶液环境的自恰反应场
藕合簇(CC)能量和分子特性
基态能量CCS,CC2,CCSD,CCSD(T),CC3,以及MP2
基态一级特性:在CCS(=SCF),CC2,MP2和CCSD级别上的偶极矩和四极矩,核电场分布和梯度的二极矩,以及标量相对论单电子修正
在CCS,CC2,MP2和CCSD级别上基态的相对论双电子Darwin修正
激发能:单重:CCS,CC2,CCSD,CC3;三重:CCS,CC2,CCSD
线性,二次和立方响应函数的谐振强度,跃迁矩和强度,吸收强度 (CCS,CC2,CCSD)
在CCS,CC2和CCSD级别上的线性,二次和立方响应函数特性及其散射系数
磁的圆二色性 (CCS,CC2,CCSD)
激发态之间的双光子跃迁矩(CCS,CC2,CCSD)
单重激发态的含频率二级特性(CCS,CC2,CCSD)
溶剂模型的穴藕合簇自恰反应场计算
分子梯度,以及分析梯度的几何优化 (CCS,CC2,MP2,CCSD)

平台:各类Unix/Linux,Win98和WinNT(Windows操作系统不正式支持,需要商业编译器,自行编译)
注意:如果在Windows下解压缩的话,有些基组的文件名不支持。

相关软件:(无)

资源:用DALTON计算激发态

***DeFT

主页:http://www.chem.uottawa.ca/DeFT.html

获得方法:直接下载。

简介:密度泛函程序。

功能:(见上)

平台:各类Unix/Linux

相关软件:(无)

注:最近已经不能访问。可以从这里下载(内含使用说明),或到教育网内搜索:

ftp://202.112.55.83/freebsd/packages-4.2-release/All/deft-2.2_1.tgz

***DFT++

主页:http://dft.mit.edu/dft++/

获得方法:直接下载。
http://dft.mit.edu/dft++/src/

简介:
从名字就看出来了,DFT++是密度泛函类从头计算的软件。

功能:(见上)

相关软件:(无)

DFTATOM & PSPCON

主页:http://www.physics.georgetown.edu/~porezag/software/

获得方法:直接下载。

简介:
DFTATOM是对球对称性原子进行完全数值密度泛函计算的工具。
PSPCON基于同样的数值原理,产生半局域Troullier-Martins赝势。

功能:(见上)

平台:Unix

相关软件:(无)

DFTGWA

主页:http://al1.phys.sci.osaka-u.ac.jp/indexecal.shtml

获得方法:发e-mail给kotani@phys.sci.osaka-u.ac.jp。

简介:从头电子结构计算程序。

功能:LMTO包括自恰场LMTO-ASA程序,完全势LMTO程序和一些有用的扩充。PW可以基于FP-LMTO和FP-LAPW进行计算。

相关软件:(无)

***Dirac

主页:http://dirac.chem.sdu.dk/

获得方法:传真或邮寄申请,获得账号和密码后就可以下载。

简介:
DIRAC是Fortran(以及一点C)语言的代码,用于基于Dirac-Coulomb哈密顿量的相对论分子计算。

功能:
1. 使用以下哈密顿量:
四分量Dirac-Coulomb(默认)
Levy-Leblond(非相对论限制的四分量算符)
使用修正Dirac方程的自旋限制哈密顿量
八种不同的ZORA
2. 支持收缩与非收缩基组
3. Dirac-Hartree-Fock模块
直接SCF
使用的对称性方案提供分子最大点群(D2h及其子群),时间反转对称性用于减少计算量。
闭壳层和开壳层(组态平均)Dirac-Hartree-Fock
波函分析:穆里肯布居数分析,投影分析
特性模块:一级特性,如偶极矩和电场梯度;二级特性,如极化率和NMR参数
4. 直接MP2能量模块
5. 藕合簇CCSD/CCSD(T)模块(Molfdir的接口)
MP2/CCSD/CCSD(T)能量
SCF和MP2级别的期望值
SCF级别的线性响应
6. 组态相关CI模块(Molfdir的接口)
7. 几何优化模块
DHF和HF的分析梯度
MP2和CCSD 的数值梯度
8. Dirac-Hartree-Fock,分子四分量转换,MP2能量和线性响应的并行模块

相关软件:(无)

资源:Dirac安装说明(中文)

DoD Planewave

主页:http://cst-www.nrl.navy.mil/people/singh/planewave/v3.0/

获得方法:发E-mail联系。singh@dave.nrl.navy.mil

简介:
DoD Planewave是密度泛函代码,处理绝缘体,半导体,金属和磁性物质。当前版本(DoD Planewave v3.xx)使用局域密度近似进行自恰电子结构,总能量和力的计算,还具有结构优化和分子动力学模拟的功能。

功能:(见上)

平台:SP2,SGI Orgin 2000

相关软件:(无)

DV-Xα

主页:http://www.sci.hyogo-u.ac.jp/ykowada/index-e.html

获得方法:直接下载。
http://www.sci.hyogo-u.ac.jp/ykowada/orgprog-e.html

简介:原子的离散变分Xα计算。

功能:(见上)

平台:Unix/linux

相关软件:(无)

DYNAMO

主页:http://www.ibs.fr/ext/labos/LDM/projet6/welcome_fr.htm

获得方法:在线注册。

简介:DYNAMO是Fortran 90模块库,使用分子动力学(MM)和混合量子力学(QM)/MM势能函数,用于模拟分子体系。

功能:
AM1,MNDO和PM3半经验QM哈密顿量
OPLS-AA MM力场
能量计算
几何优化
寻找过渡态
反应路径计算
简正模式分析
特性计算(电荷和偶极矩)
分子动力学计算
Langevin动力学计算
蒙特卡罗(Monte Carlo)计算
各种“软”几何结构限制
各种分析工具

相关软件:(无)

资源:
M. J. Field
A Practical Introduction to the Simulation of Molecular Systems
Cambridge University Press
该书介绍如何用DYNAMO完成各种计算。已由世界图书出版公司影印出版,59元RMB。

Ecce

主页:http://www.emsl.pnl.gov:2080/docs/ecce/index.html

获得方法:添好申请表,寄给:ecce-support@emsl.pnl.gov

简介:Ecce由一套基于X Window系统应用程序的分布式客户机/服务器UNIX组成,提供完善的图形用户界面,量化计算可视化工具和数据管理系统。

功能:
1. 支持建立分子模型
2. 提供量化计算图形用户界面(GUI)。支持的代码有:NWChem,Gaussian 94/98。
3. 用于基组选择的GUI。基组库中目前包含了140种以上的机组。
4. 支持远程计算。
5. 支持的分子特性计算包括:振动频率,分子轨道,分子密度,偶极、四极矩,Mulliken电荷,几何优化和能量。

平台:运行Solaris 2.6,Solaris 2.8的Sun SparcStation,运行RIX 6.5的SGI。LINUX工作站版即将推出。

相关软件:(无)

ENDyne

主页:http://www.qtp.ufl.edu/endyne.html

获得方法:发e-mail给endyne@qtp.ufl.edu。

简介:ENDyne是执行电子核动力学理论,使用含时和自恰方法研究分子构型和电子结构之间相互作用的程序。

功能:(见上)

平台:IBM,Sun

相关软件:(无)

ESPOIR

主页:http://www.cristal.org/sdpd/espoir/
http://pcb4122.univ-lemans.fr/sdpd/espoir/

获得方法:直接下载。

简介:通过拟合单晶数据或粉末衍射“|Fobs|”,用从头计算研究晶体结构的反转Monte Carlo代码。软件是图形用户界面,使用简便。

功能:(见上)

平台:DOS,Win95/98/NT,Unix/Linux

相关软件:(无)

***FHI98md

主页:http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/fhi98md/

获得方法:直接下载。(不包括源代码,源代码需付费)
http://theowww.rz-berlin.mpg.de/~fhicp/download/demo/

简介:
FHI98md对绝缘体到过渡金属等材料进行密度泛函总能量计算,使用赝势和平面波基组。执行局域密度近似和广义梯度近似的交换和相关。内存要求低,可以有效地在低配置的PC机和高性能计算机上运行。

功能:
用原子轨道快速初始化
原子驰豫
有限温度下的分子动力学
偶极修正
电场
寻找电子基态
LDA,GGA和PBE XC泛函
各种输出程序:(电荷密度,静电和有效势,3D-和XY-平均)
自动的输入生成程序
其它工具

平台:各类Unix/Linux,WinNT

相关软件:

1. EZWAVE

简介:图形界面的fhi98md。正在调试中。使用说明见:
http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/JG/E5PS.htm

平台:Windows

2.*** fhi98PP

简介:赝势基组生成程序。

地址:http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/fhi98md/fhi98PP/index.html

获得方法:直接下载。
http://www.fhi-berlin.mpg.de/th/fhi98md/download/index.html#fhipp

3. XCrySDen

主页:http://crystal.ijs.si/kokalj/xc/

获得方法:填写申请表,获得下载的账号和密码。

简介:显示晶体结构的程序。

功能:
特性分析
提供晶体从头计算程序CRYSTAL95/98的图形用户界面
晶体从头计算程序WIEN97的晶体结构可视化,产生二维/三维电子密度,生成用于键结构图的k-栅格
FHI98MD程序的晶体结构可视化

平台:各类Unix,要求有X-window支持。

***GAMESS (USA)

主页:http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html

获得方法:直接下载,但需要注册才能得到解压缩密码。
http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/pcgamess.shtml
其它下载地址:
http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/download.html
http://www.orgchm.bas.bg/pub/GAMESS/
注:这个软件以前限制在中国大陆使用,但最近据说可以申请了。大家不妨试试。(本信息由轩小朋提供)

简介:
从头计算量子化学程序。可以从RHF,ROHF,UHF,GVB和MCSCF计算波函,其中一些使用CI和MP2修正。自恰场的分析梯度用于自动几何优化,过渡态寻找,跟踪反应路径。能量hessian的计算允许预测振动频率。可以大量的分子特性,从简单的偶极矩到含频率超级极化率。内部储存了大量基组和有效核势,分子中可以包含到Ra的所有元素。几个图形程序用于显示最终结果。支持并行计算。

功能:
1. 计算RHF,UHF,ROHF,GVB或MCSCF自恰场波函。
2. 计算自恰场能量的CI或MP2修正。
3. 半经验MNDO,AM1或PM3波函计算。
4. 对所有自恰场波函计算分析能量梯度,加上闭壳层MP2或CI。
5. 使用能量梯度,按照笛卡尔或内坐标优化分子结构。
6. 寻找势能曲面和鞍点。
7. 计算能量hessian,得到简正模式,振动频率和红外强度。
8. 追踪反应路径。
9. 计算辐射跃迁特性。
10. 计算自旋-轨道藕合波函。
11. 计算以下分子特性:
a. 偶级、四极、八极距
b. 静电势
c. 电场和电场梯度
d. 电子密度和自旋密度
e. Mulliken和Lowdin布居数分析
f. 维里定理和能量成分
12. 模拟溶剂影响,使用:
a. 有效片断势(EFP)
b. 极化连续模型(PCM)
c. 自恰反应场(SCRF)

平台:各类Unix/Linux,Windows,和Mac机

相关软件

1. Barchetta

主页:http://www.orgchm.bas.bg/pub/GAMESS/Barchetta/Barchetta.html

获得方法:直接下载。

简介:Barchetta是X-windows程序,用于显示分子的结构和轨道。用于观察GAMESS的输出结果。

平台:SGI, IBM, DEC, SUN工作站。

2. ***BatchMan

主页:http://www.univ-orleans.fr/SCIENCES/ICOA/batchman/

获得方法:直接下载。

简介:包含控制Gamess、MOPAC计算的用户界面。

平台:Win98,WinNT

3. ***Gambuild

主页:http://pro122lin.chemie.hu-berlin.de/wessig/software/

获得方法:直接下载。

简介:
另一种专门为Gamess设计的用户界面,既有简单的菜单输入界面,也有编辑复杂输入文件的手动编辑界面(需要了解GAMESS的输入格式和关键字,就像Gaussian98W一样),同时具有顺序运行最多十个运算任务的功能。

平台:Win98,WinNT

资源:Gambuild中文使用说明

4. ***GAMESOL

主页:http://comp.chem.umn.edu/gamesol/

获得方法:邮寄申请信得到下载账号和密码。

简介:GAMESOL是把SM5.42溶剂模型结合到GAMESS代码中的模块。GAMESOL给GAMESS添加了以下功能:
Löwdin局部原子电荷
气相和液相的CM2 Class IV电荷
使用Löwdin局部原子电荷的广义Born静电溶剂模型
SM5.42R/HF和SM5.42R/HF溶剂模型
NDDO-SRP方法

平台:各类Unix/Linux

(轩小朋提供)

5. ***Molden

主页:http://www.caos.kun.nl/~schaft/molden/molden.html

获得方法:直接下载。

简介:图形化显示GAMESS的计算结果。

平台:Windows(需要商业软件MicroImages X Server支持),各类Unix/Linux

6. ***Visualize

主页:http://www.compbio.net/

获得方法:填好注册表后就可以下载。

简介:
专门为Gamess设计的用户界面,使得结构与命令的输入更简单,但是菜单的功能比较少,计算的结果可以用三维图形显示出来。同时还有蒙特卡罗方法。

平台:Windows

7. QMView

主页:http://www.sdsc.edu/QMView/

获得方法:不详。请与软件作者联系。

简介:
GAMESS(US)的图形用户界面,兼有观察计算结果显示分子模型的功能。

平台:Unix,WINDOWS 9x/NT

GDMA

主页:http://www-stone.ch.cam.ac.uk/documentation/gdma/README.html

获得方法:直接下载。

简介:GDMA程序对Gaussian计算得到的波函进行分布式多极分析,结果为一组多极矩,精确描述分子静电场。

功能:(见上)

相关软件:(无)

Geomos

主页:http://www.lctn.u-nancy.fr/logiciels.html

获得方法:直接下载。

简介:半经验量化计算软件,可以使用大多数当前的半经验方法。用于分子几何优化,计算分子和光谱特性(IR,UV,NMR,..)。通过使用连续模型,可以引入溶液影响。

功能:(见上)

相关软件:(无)

GULP

主页:http://www.ch.ic.ac.uk/gale/Research/gulp.html

获得方法:与j.gale@ic.ac.uk联系。

简介:
GULP可以对三维周期性固体,气相团簇和大体积材料中的隔离缺陷进行各种模拟。通过使用壳模型,GULP还可以处理分子固体和离子材料。与其它模拟程序不同的是,GULP对固体使用对称性从而简化输入,加速计算。这会有一个数量级的改善。

功能:
1. 体系的类型:三维大体积材料,团簇,缺陷
2. 能量最小化
3. 过渡态
4. 晶体特性:弹性常数,体积模数,扬氏模数,泊松率,静电绝缘常数,高频绝缘常数,折射指数,压电常数,声子频率,声子态密度,声子态密度投影,声子散射曲线,k空间的Patterson对称性,零点振动能,熵(恒定体积),热容(恒定体积),Helmholtz自由能,静电势,电场,电场梯度
5. 缺陷:Mott-Littleton方法,缺陷能量,缺陷位移的过渡态,缺陷频率
6. 拟合。弹性常数,静电和高频介电常数,晶格能,压电常数,梯度,频率,电势和结构的经验拟合
7. 分子动力学(NVE)
8. 结构分析:键长,键角,扭转角,密度和单元体积。
9. 为其它程序产生输入文件:Marvin,Cerius2,InsightII,G-VIS,SIESTA

平台:Linux/Unix,Mac OS

相关软件:(无)

Herman-Skillman

主页:http://www.fi.uib.no/Teori/KURS/Hartree/H-F/LINK/lindex.html

获得方法:直接下载。

简介:进行原子Hartree-Fock自恰场计算的代码。

功能:(见上)

平台:Unix/linux

相关软件:(无)

***HONDO/S

主页:http://comp.chem.umn.edu/hondo/s/

获得方法:填写申请表,发传真,得到下载账号和密码。

简介:
HONDO/S-v.3.0是HONDO 99.6的一个版本,使用Hartree-Fock和混合DFT-Hartree-Fock方法求解Löwdin和CM2部分原子电荷,以及执行SM5.42R和SM5.42连续解的计算。
HONDO/S-v.1.0也称作HONDOSOL,而原来的HONDOSOL已经改了名字。HONDO/S是对HONDO在溶剂,光谱学,散射和半经验DFT方面的增强版。

功能:
1. 由限制和非限制的波函得到Löwdin部分原子电荷。
2. 气相和液相CM2 Class IV电荷计算,使用限制和非限制的Hartree-Fock,DFT,以及使用了球谐(5D)或笛卡尔(6D) d函数的混合HF-DFT波函:
HF/MIDI!
HF/MIDI!6D
HF/6-31G*
HF/6-31+G*
HF/cc-pVDZ
B3LYP/MIDI!
BPW91/6-31G*
BPW91/MIDI!
BPW91/MIDI!6D
BPW91/DZVP
3. 液相分析梯度和SM5.42的计算,使用限制和非限制的Hartree-Fock,DFT,以及使用了笛卡尔d壳层的混合HF-DFT波函:
HF/MIDI!6D
HF/6-31G*
BPW91/6-31G*
BPW91/MIDI!6D
BPW91/DZVP
以上五个应用允许液相最小值和鞍点的几何优化,以及振动频率求值。
4. 刚性液相计算,即基于气相几何的SM5.42R计算,使用限制和非限制的波函。
5. 使用Löwdin部分原子电荷的广义Born静电溶剂能量的计算,对于笛卡尔或球谐s,p,d和f基函数,可用于所有的RHF,UHF,DFT,非限制的DFT,混合HF-DFT,以及混合UHF-DFT。
6. 使用Löwdin部分原子电荷和ISCRF=1的广义Born静电溶剂能量分析梯度,可用于所有的RHF,UHF,DFT,非限制的DFT,混合HF-DFT,以及混合UHF-DFT波函,使用笛卡尔d和f(6D/10F)基函数。使用分析梯度可以进行液相最小值和鞍点的几何优化和振动频率求值。

相关软件:(无)

Hückel

主页:http://www.oraxcel.com/projects/huckel/

获得方法:填写注册单,选择Huckel Free,直接下载。

简介:进行Hückel理论计算的程序。图形界面,简单易用。

功能:(见上)

平台:Windows 95/NT

相关软件:(无)

***ICON-EDiT

主页:http://iacrs1.unibe.ch/program/iconedit.html

获得方法:直接下载。

简介:休克尔分子轨道和谐振强度计算软件。

功能:(见上)

平台:各类Unix/Linux,Windows

相关软件:(无)

ISOEFF98

主页:http://ck-sg.p.lodz.pl/isoeff/isoeff.html

获得方法:直接下载。

简介:
ISOEFF98 (Windows版)是图形界面程序,使用Bigeleisen方程,从量子力学结果中计算同位素影响。它首先从GAMESS,Gaussian和Mopac输出结果中获得Z-矩阵信息和力常数矩阵,接下来通过改变同位素的质量,把力常数转换为质量加权力常数,之后对其进行对角化,获得振动频率和同位素影响。

功能:
1. 处理GAMESS,Gaussian和Mopac格式输出文件。
2. 支持的格式有:MOPAC, AMPAC, AMSOL, SIBIQ, GAMESS, GAUSSIAN, HYPERCHEM …
3. 同位素替换。
4. 定义多个任务。
5. 比例因子优化。
6. Hessian修正。
7. 从Hessian计算频率。
8. 用GAMESS型Z-矩阵控制冗余内坐标。
9. 通过输入文件内容,自动确定其类型。
10.自动从Gaussian冗余内坐标建立Z-矩阵。

平台:DOS/Windows,Unix

相关软件:(无)

***Level

主页:http://scienide.uwaterloo.ca/~leroy/level/

获得方法:填写申请表,会把fortran源程序和示例文件发送到email信箱。编译源代码后即可使用。

简介:Level是一个对束缚态和准束缚态求解径向薛定谔方程的免费程序,可以由双原子分子的势能曲线(从光谱分析或从头计算获得)计算该电子态的光谱常数和跃迁特性。

功能:
1. 势能曲线插值。对于用从头计算获得的双原子分子势能曲线数据作图,这一功能非常重要。
2. 求解光谱常数:平衡键长;能级高度;振动光谱常数ωe,ωeχe,ωeye等;转动光谱常数,包括六个离心畸变常数(Dv,Hv,Lv,Mv,Nv,和 Ov)。
3. 计算激发态的跃迁特性。包括Franck-Condon因子,爱因斯坦系数。
4. 对准束缚态和双势阱态的计算。

平台:Windows/DOS,Unix/Linux

资源:Level 7.4程序使用手册(中文)

LmtART

主页:http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/docs/lmtoart_programs.html

获得方法:直接下载。

简介:完全势能muffin-tin轨道(LMTO)方法的程序。

功能:(见上)

相关软件:(无)

LMTO

主页:http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/docs/lmtolr_man.html

获得方法:直接下载。
http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/docs/lmtolr_prog.html

简介:线性响应muffin-tin轨道(LMTO)方法的程序。包含:LMTO Electrons,LMTO Phonons,LMTO Magnons。

功能:(见上)

相关软件:(无)

MARVIN

主页:http://www.ri.ac.uk/DFRL/MARVIN/

获得方法:与Ben Slater联系。

简介:MARVIN用于计算表面和分界面的静力学和动力学模型。

功能:
1. 使用基于离子间或分子间势能的原子力场,模拟:
表面和分界面的最小值
表面和分界面的分子动力学
静态Docking
蒙特卡罗Docking
2. 支持大量的泛函形式,研究离子,半离子和分子表面问题。
3. 支持串行和并行计算。
4. 在内存允许的情况下研究巨型体系的问题,如谷物的表面,需要模拟包含超过50,000个原子的细胞。

平台:IRIX,UNICOS,OSF,AIX,LINUX和MAC OS。

相关软件:(无)

mini

主页:http://www.lcp.u-psud.fr/Pageperso/lauvergnat/mini/mini.html

获得方法:直接下载。

简介:通过编辑脚本使该程序和其它任何量化程序链接,进行变量优化(最小值和过渡态),还可以计算梯度,Hessian矩阵,频率。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:

freq_rb

主页:http://www.lcp.u-psud.fr/Pageperso/lauvergnat/freq_rb/freq_rb.html

获得方法:正在构建中,尚不能下载。

简介:它是对mini程序的修正,计算刚体频率。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

MIT Photonic-Bands

主页:http://ab-initio.mit.edu/mpb/

获得方法:直接下载。

简介:
用于计算键结构和周期绝缘结构的电磁模式。该程序使用完全矢量和三维方法,对周期绝缘结构的任意波矢计算确定频率麦克斯韦方程组的本征态。它主要用于研究光子晶体,但也可以用于解决光学方面的其它问题,如波导和共振体系。(例如,它可以求解任意交叉部分的波导模式)

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

***MolEdit

主页:http://www.organik.uni-erlangen.de/clark/gedeck/software/moledit.html

获得方法:直接下载。

简介:
Mopac输入文件编辑器。在编辑的同时检查文件结构的正确性,一旦出现错误的输入格式,就会提供出错信息。这个编辑器与molecule-viewer结合可以检查定义的几何结构。这特别是对z-矩阵非常有价值。MolEdit提供的界面简化了Babel的使用。还能用于载入、编辑和保存UNIX文件。

功能:
支持文件格式:
1. Mopac文件格式,用于半经验程序包Ampac,Mopac和Vamp
2. GIP (geometry-interchange-program)格式
3. Xmol格式
4. 其它格式,可以通过格式转化工具Babel得到Gaussian输入文件格式。

平台:Windows

相关软件:(无)

***MOLFDIR

主页:http://theochem.chem.rug.nl/~broer/Molfdir/Molfdir.html

获得方法:网上注册,获得下载地址。

简介:
MOLFDIR是进行分子Dirac-Fock多电子计算以及相关计算的量化代码。可以分析波函,进行相对论组态相关和相对论藕合簇计算,还可以产生收缩基组。程序可以处理Oh双群及其所有双群子群对称性的分子,并可考虑时间反转对称性。软件包结构灵活,可以对目前的结构进行优化和添加,为研究相对论量子化学提供了舞台。最新升级:2001年九月。

功能:(见上)

相关软件:(无)

molscat

主页:http://www.giss.nasa.gov/molscat/

获得方法:直接下载。

简介:MOLSCAT是求解无反应分子散射问题量子力学代码,用于各种类型的碰撞问题。

功能:(见上)

相关软件:(无)

MondoSCF

主页:http://www.t12.lanl.gov/home/mchalla/

获得方法:联系rpoirier@mun.ca。

简介:MondoSCF用Fortran95编写,加入了一些C程序,用于在笛卡尔-高斯LCAO基中执行Hartree-Fock,纯密度泛函,以及混合HF/DFT计算。能够计算1k到10k个原子的体系。对非金属体系使用O(N)或O(N lg N)方法,并行解SCF方程。可以计算周期边界坐标和梯度。

功能:(见上)

平台:IRIX/MIPSF90,LINUX/PGF90,LINUX/NAGF95,LINUX/ABSOFTF95,AIX/XLF90

相关软件:(无)

***MOPAC

主页:(无)

获得方法:很多地方可以下载。
Linux版(MOPAC 7.0):
http://www.ccl.net/cca/software/LINUX/mopac7/index.shtml
DOS版(MOPAC 6.0):
http://www.ccl.net/cca/software/MS-WIN95-NT/mopac6/index.shtml
Linux & MS-DOS版(MOPAC 7.0):
ftp://esca.atomki.hu/mopac7/

简介:
半经验分子轨道程序包,用于研究分子结构和化学反应。使用MNDO,MINDO/3,AM1和PM3理论方法获得分子的轨道,生成热和分子结构。MOPAC可以计算分子、原子团和聚合物的振动光谱,热力学量,同位素影响和力常数。其中的一个过渡态定位程序和两个过渡态优化程序用于研究化学反应。

功能:(7.0版,其中某些功能是6.0版所没有的)
1. MNDO,MINDO/3,AM1和PM3哈密顿量
2. 限制Hartree-Fock (RHF)和非限制Hartree-Fock (UHF)方法
3. 大范围的组态相关
(a) 100个组态
(b) 单重,双重,三重,四重,五重和六重
(c) 激发态
(d) 指定态的几何优化,等
4. 单自恰场计算
5. 几何优化
6. 梯度最小化
7. 过渡态定位
8. 反应路径坐标计算
9. 力常数计算
10. 简正坐标分析
11. 跃迁偶极计算
12. 热力学特性计算
13. 局域化轨道
14. 共价键顺序
15. 键分解为sigma和pi分量
16. 一维空间聚合物计算
17. 动力反应坐标计算
18. 内反应坐标计算

相关软件:

***BatchMan

主页:http://www.univ-orleans.fr/SCIENCES/ICOA/batchman/

获得方法:直接下载。

简介:包含Gamess、MOPAC计算控制的用户界面。

平台:Windows,Linux

MP-DFT

主页:http://www.mcc.uiuc.edu/software/Pages/MP-DFT.htm

获得方法:在线注册,获得下载的账号和密码。

简介:多重并行密度泛函理论(DFT)代码。

功能:MP-DFT的核心部分是基于DFT的标准第一原理结构计算程序。这个DFT子程序提供了在周期性模拟单元中的原子势能曲面。余下的部分提供了估算物理量的功能,例如电子结构的优化原子组态,经典分子动力学,等。

平台:Origin2000

相关软件:(无)

***MPQC

主页:http://aros.ca.sandia.gov/~cljanss/mpqc/

获得方法:直接下载。
http://aros.ca.sandia.gov/~cljanss/mpqc/download.html

简介:
MPQC是大型并行量化计算程序,由第一定律,使用时间无关薛定谔方程计算原子和分子的特性。它用C++语言编写。

功能:
闭壳层和一般限制的开壳层Hartree-Fock能量和梯度
二级开壳层微扰理论(OPT2[2])和Z-平均微扰理论(ZAPT2)的能量
二级闭壳层Møller-Plesset微扰理论能量和梯度
强大的内坐标几何优化,有效优化有许多自由度的分子

相关软件:

*** Ghemical

主页:http://www.uku.fi/~thassine/ghemical/

获得方法:直接下载。

功能:图形化显示MPQC的计算结果,并可作为MPQC的图形界面终端,支持量子化学计算。。

平台:各类UNIX,PC WIN32

MULTIMODE

主页:http://www.emory.edu/CHEMISTRY/faculty/bowman/multimode/

获得方法:联系Stuart Carter (S.Carter@reading.ac.uk)

简介:
对多原子分子、过渡态、团簇等的振-转能量和波函进行振动自恰场(VSCF)和几类组态相关计算。代码基于非线性分子的Watson哈密顿量(线性分子版本即出)。处理对于零和非零总角动量J非常严格,也可以使用转动的绝热处理作为近似方法。对于势能的处理颇为新颖,可以用到多模式的体系中。

功能:(见上)

相关软件:(无)

NAMD

主页:http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/

获得方法:传真或邮寄申请,获得账号和密码后就可以下载。

简介:NAMD是面向对象的分子动力学代码,用于大型生物分子的高性能模拟。

功能:(见上)

平台:Windows,Unix/Linux

相关软件:(无)

NRLMOL

主页:http://cst-www.nrl.navy.mil/~nrlmol/

获得方法:通过传真或普通信件提交申请,获得下载的账号和密码。

简介:
NRLMOL对分子和团簇进行密度泛函计算的程序。

功能:
Gaussian基组中电子的Kohn-Sham轨道(波函)展开
提供局域的和梯度修正密度泛函
Poisson方程分析解
自动生成高精度积分格(任意精度可调)
任意对称性
半局域赝势
可以生成势、密度、波函的栅格
态节点的电子密度
通过使用NRLMOL和辅助程序SPECSYM预测IR和Raman振动光谱
友好的用户启动界面

平台:PC Linux(用g77和pgf77编译)和各种工作站

相关软件:(无)

***Num2d

主页:http://www.csc.fi/~laaksone/Num2d.html

获得方法:直接下载。

简介:
只能用于双原子分子的数值Hartree-Fock程序

功能:
对称性识别
多极矩
用于闭壳层和开壳层情况
连接到Gaussian的界面
对原子中心类氢函数的zeta参数的要求灵活

平台:UNIX,PC WIN32

相关软件:(无)

NWChem

主页:http://www.emsl.pnl.gov:2080/docs/nwchem/

获得方法:填写申请表,通过传真或普通信件注册,获得下载的账号和密码。

简介:
NWChem是运行在高性能并行超级计算机和通常工作站集群上的计算化学软件,可以用在大多数计算平台上。NWChem使用标准量子力学描述电子波函或密度,计算分子和周期性系统的特性,还可以进行经典分子动力学和自由能模拟。

功能:
1. 分子的电子结构
1) 下面的方法计算能量和分析原子坐标一级导数。二级导数由一级导数的有限差分计算。
自恰场(SCF)或Hartree-Fock(RHF,UHF,高自旋ROHF)
高斯密度泛函理论(DFT),使用正常的N3和N4标量的局域和非局域交换相关势(RHF或UHF)
自旋-轨道DFT(SODFT),使用多个局域和非局域交换相关势(UHF)
MP2,包括半直接使用的冻结核以及RHF和UHF参考
完全活性空间SCF(CASSCF)
2) 下面的方法仅用于计算能量。一级和二级导数由能量的有限差分计算。
CCSD,CCSD(T),CCSD+T(CCSD),使用RHF参考
二级微扰修正的选择CI
MP2,完全直接使用RHF参考
分解恒等积分近似MP2(RI-MP2),使用RHF和UHF参考
3) 对所有的方法,下面的操作都适用。
单点能
几何优化(最小值和过渡态)
整个从头势能曲面上的分子动力学
如果分析导数不能使用,自动计算数值的一级二级导数
笛卡尔坐标的简正振动分析
Morokuma及其合作者的ONIOM混合方法
产生电子密度文件用于图形显示
静电和单电子特性的求值
原子局部电荷的静电势匹配(CHELPG方法,加上可选的RESP限制或电荷约束)
4) 对于闭壳层和开壳层的SCF和DFT:
COSMO能量
5) 另外,自动提供到以下程序的界面:
COLUMBUS的多重参考CI包
NBO包
Python
2. 相对论影响
以下的方法在量化计算中包括相对论
自旋自由单电子Douglas-Kroll近似用于所有量子力学方法及其梯度
Dyall自旋自由修正Dirac哈密顿量近似用于Hartree-Fock方法及其梯度
用自旋-轨道势包含单电子自旋-轨道影响。这个选项用于DFT及其梯度,但必须在没有对称性的情况下运行。
3. 赝势平面波电子结构
下面的模块使用赝势平面波DFT计算能量,最小化几何结构和分子动力学从头计算。
固定步长递降
Conuugate梯度
Car-Parrinello(扩展拉格朗日动力学)
包括
Vosko和PBE96交换相关势(限制与非限制)
(Gamma点)周期正交模拟单元,用于计算分子,液体,晶体和表面
非周期正交模拟单元,用于计算带电或高度极化的分子
常温恒定能量下Car-Parrinello模拟
使用半核修正的Hamann和Troullier-Martins规范守恒赝势
大、小平面波展开之间的转换模块
DRIVER,STEPPER和VIB模块的界面
穆里肯分析
4. 周期体系电子结构
模块(聚合物,表面和固体的高斯方法,GAPSS)使用包含多个局域和非局域交换相关势的高斯DFT用于计算能量
5. 分子动力学
6. Python
NWChem内植入了Python程序语言,用户可以很容易地组合和控制NWChem的许多高级功能,进行复杂的操作。
7. 并行工具和库(ParSoft)

平台:各类Unix/Linux,Win98和WinNT

相关软件:图形用户界面Ecce。

ORIENT

主页:http://www-stone.ch.cam.ac.uk/documentation/orient3.2/manual.html

获得方法:直接下载。
http://www-stone.ch.cam.ac.uk/pub/orient3.2j.tar.gz

简介:Orient是进行各种类型的分子相互作用计算的程序,它使用用户逐点指定的势,包括静电,感应,排斥,散射,以及电荷转移相互作用。能够进行分子动力学和Monte Carlo计算。

功能:(见上)

相关软件:(无)

Paratec

主页:http://www.nersc.gov/research/SCG/Andrew/man4/man4.html

获得方法:与Andrew Canning(canning@nersc.gov)联系,得到密码才能下载。

简介:
赝势平面波DFT代码,可用各种泛函做并行计算。代码本身带有可视化功能。

功能:(见上)

平台:Single-Node RS6000,IBM SP2,SGI PowerChallenge,T3E,DEC Alpha

相关软件:(无)

PEtot

主页:http://www.nersc.gov/~linwang/PEtot/PEtot.html

获得方法:直接下载。

简介:基于密度泛函理论的用于原子总能量计算的并行平面波赝势程序。

功能:(见上)

平台:大型并行计算机,如Cray T3E和IBM SP

相关软件:(无)

POLYMER

主页:
1. POLYMER 1.0
http://www.qtp.ufl.edu/~hirata/polymer.html
2. POLYMER 2.0
http://www.qtp.ufl.edu/~hirata/polymer20.html

获得方法:
直接下载。下载后请通过E-mail通知原作者。(2.0版本源代码即将发布,尚不能下载。)

简介:
1. POLYMER 1.0
晶体轨道从头计算和聚合物无穷一维网格密度泛函程序。
2. POLYMER 2.0
晶体轨道从头计算和聚合物无穷一维和二维网格密度泛函程序。

功能:
1. POLYMER 1.0
单点能:
Hartree-Fock(HF)理论
二级多体微扰理论(MBPT2)
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)
单组态相关(CIS)理论
含时间Hartree-Fock (TDHF)理论
含时间密度泛函理论(TDDFT)
激发能的多体微扰/Green函数理论(MBPT2/CIS, Dyson2/CIS)
优化有效势(OEP)或严格轨道交换(EXX)方法(只用于分子)
行列式一般级别的组态相关(CI),多体微扰(MBPT)和藕合簇(CC)方法(只用于分子)

能量梯度分析:
Hartree-Fock(HF)理论
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)

其它特性:
双电子积分直接硬盘求值
几何优化
对于SCF和几何优化的直接转置迭代子空间(DIIS)外推
HF,DFT和MBPT2恒等积分近似的求解
MBPT2和Dyson2准粒子能量键结构
能量和Fock矩阵的多级展开修正

2. POLYMER 2.0
i)零维网格(原子和分子)。
单点能:
Hartree-Fock(HF)理论
多体微扰理论(MBPT2和MBPT3)
藕合簇理论(CCD, LCCD, ACCD, CCSD, QCISD, 和LCCSD)
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)
单组态相关(CIS)理论
含时间Hartree-Fock (TDHF)理论
含时间密度泛含理论(TDDFT)
激发能的多体微扰/Green函数理论(MBPT2/CIS, Dyson2/CIS)
优化有效势(OEP)或严格轨道交换(EXX)方法
行列式一般级别的组态相关(CI),多体微扰(MBPT)和藕合簇(CC)方法
行列式一般级别的藕合簇微扰理论(CCPT)

能量梯度分析:
Hartree-Fock(HF)理论
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)

ii)一维网格(聚合物)。
单点能:
Hartree-Fock(HF)理论
多体微扰理论(MBPT2和MBPT3)
藕合簇理论(CCD, LCCD, ACCD, CCSD, QCISD, 和LCCSD)
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)
单组态相关(CIS)理论
含时间Hartree-Fock (TDHF)理论
含时间密度泛含理论(TDDFT)
激发能的多体微扰/Green函数理论(MBPT2/CIS, Dyson2/CIS)

能量梯度分析:
Hartree-Fock(HF)理论
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)

iii)二维网格(板面)。
单点能:
Hartree-Fock(HF)理论
局域和梯度修正以及混合密度泛函(DFT)

能量梯度分析:
Hartree-Fock(HF)理论

其它特性:
双电子积分直接硬盘求值
几何优化
对于SCF和几何优化的直接转置迭代子空间(DIIS)外推
HF,DFT和MBPT2恒等积分近似的求解
MBPT2和Dyson2准粒子能量键结构
能量和Fock矩阵的多级展开修正
二维体系的快速多级展开修正

平台:IBM RS/6000(Fortran 90编译器)或SP2(C shell script)

相关软件:(无)

POLYRATE

主页:http://comp.chem.umn.edu/polyrate/

获得方法:打印填好许可文件,发传真,得到有下载密码的email。

简介:POLYRATE是计算多原子分子(也包括原子、双原子分子的特例)的化学反应速率的程序,使用变分或传统的过渡态理论。POLYRATE使用其它程序计算的数据作为输入(例如GAMESS或Gaussian的结果可以用作POLYRATE的输入),计算额外的信息。

功能:(见上)

平台:IBM SP with PowerPC 604e 处理器 (AIX 4.3.1),Silicon Graphics Power Challenge L with R10000 (IRIX 6.5)

相关软件:(无)

Pseudopotential程序

主页:http://bohr.inesc.pt/~jlm/pseudo.html

获得方法:直接下载。

简介:
Sverre Froyen (U.C. Berkeley)和Norm Troullier开发的赝势生成程序。有一个测试过的LDA程序,用于构造各种泛函的Troullier-Martins,Hamann-Schluter-Chiang,和Kerker赝势(球平均,半相对论)。还有一个扩展到GGA级别的新版本。

功能:(见上)

平台:各种Unix

相关软件:(无)

PSI 3

主页:http://vergil.chemistry.gatech.edu/psi/

获得方法:发E-mail联系:psi@ccqc.uga.edu。

简介:
最新版本的PSI程序是PSI3。PSI3研究的中心问题是小分子的高精度计算。它具有雄厚的新理论基础,消除了许多潜在的瓶颈–它可以处理几乎是任意数量的基函数(目前极限是32000以下,可以很容易修改成更大数量),基函数的任意角动量,基本上是任意的文件大小,以及灵活的新checkpoint文件。新的积分代码允许直接积分求值,不必存储非常大的积分文件。PSI3的大部分适合于64位计算,并可以使用2GB以上的内存。代码对共享内存体系实现了并行化。

功能:
1. SCF能量(RHF, ROHF, UHF, TCSCF)。
2. 直接SCF能量(RHF, 高自旋ROHF, UHF)。
3. SCF梯度(RHF, ROHF, TCSCF)。
4. SCF二阶导数(RHF;初步实现)。
5. CCSD能量(RHF, ROHF, UHF, 允许冻结核);基于AO的四个虚数积分贡献的求值。
6. CCSD梯度(RHF CCSD, ROHF CCSD)。
7. CCSD(T)能量(RHF, UHF)。
8. EOM-CCSD用于全部对称性的激发。
9. RAS-CI和完全CI能量(基于RHF-和ROHF)。
10. CASSCF能量。
11. 传统的MP2和MP2-R12能量(基于RHF)。
12. 任意级别的RHF MPn。
13. 各种单电子特性:电偶极矩到电八极矩,超精细结构常数,静电势,电场梯度,密度梯度和Laplacian。
14. 支持任意高角动量的直到32768个 Gaussian基函数。
15. 使用分析梯度时的自动几何优化。

平台:IBM AIX,Intel Linux,Compaq Tru64 Unix,Alpha Linux(这种平台目前对科学计算还有些问题)。

相关软件:(无)

PWSCF & PHONON

主页:http://www.sissa.it/cm/PWcodes/info/ (说明文档)

获得方法:直接下载。http://www.sissa.it/cm/PWcodes/

简介:PWSCF是通用电子结构代码,用平面波赝势(PWPP)方法执行密度泛函总能量计算。PHONON是线性响应PWPP代码,使用密度泛函微扰理论计算固体的振动特性。

功能:PWSCF的特性:自旋极化LDA和GGA泛函,结构优化,分子动力学。

平台:Unix/Linux。

相关软件:(无)

QDyn

主页:http://www.jh-inst.cas.cz/toISO-8859-1/hp/qdyn/Sources/index.html

获得方法:直接下载。

简介:
QDyn用于进行CSP(Classical Separable Potential)模拟。CSP模拟适用于对包含多达几百个原子的中等量子体系进行量子动力学描述。QDyn中使用了最简单的CSP方法,使用以下近似:Born-Oppenheimer近似;可分离性近似;经典可分离势。扩展的CSP,如非绝热CSP或组态相互作用扩展CSP(CI-CSP),没有包含在QDYN 1.0版本中。

功能:
QDyn包含四个软件包:Mode,QDyn,Analysis和XAnalysis。Mode用于寻找系统结构的最小值和正则坐标,计算简正频率。QDyn进行量子动力学传播计算。Analysis是交互程序,从QDyn非格式化输出文件获取信息。它创建的ascii文件包括CSP势,CSP波函,自相关函数,能量-时间变化,原子间距离,光谱,……这个ascii可以用标准的画图程序处理。XAnalysis是用于分析的X模拟程序。它载入非格式化文件,并在屏幕上显示图像。

相关软件:(无)

QMD

主页:http://nemo.physics.ncsu.edu/software/MGDFT-QMD/

获得方法:直接下载。

简介:多网格实空间电子结构代码。在密度泛函理论框架内进行从头分子动力学模拟。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

RACAH

主页:http://www.physik.uni-kassel.de/fritzsche/programs.html

获得方法:直接下载。

简介:
计算原子光谱精细结构的Maple程序。能够处理LS-藕合和jj-藕合。

功能:(见上)

相关软件:(无)

range energy code

主页:http://ultraman.ssl.berkeley.edu/~weaver/dedx/ (程序说明)

获得方法:直接下载。
ftp://underdog.ssl.berkeley.edu/pub/dedx/

简介:
精确求解Dirac方程,计算锕系和可能包含超重元素的亚锕系宇宙射线的电离能损失。

功能:(见上)

平台:只用于SunOS和Linux,需要C编译器。

相关软件:(无)

RATIP

主页:http://www.physik.uni-kassel.de/fritzsche/programs.html

获得方法:直接下载。

简介:
从用相对论系统化研究原子的工具GRASP92扩充而来。GRASP92界面友好,研究原子特性,包括能级能量,超精细结构,辐射跃迁几率。
RATIP可以计算原子的跃迁和电离特性。软件包使用原子态扩展到行列式基的放松轨道组,进行跃迁几率,俄歇率,角分布参数以及光电离交叉部分的计算。

功能:(见上)

相关软件:(无)

ScienceMark

主页:http://w3.physics.uiuc.edu/~wilkens/

获得方法:直接下载。

简介:ScienceMark是三个计算代码的集合:
QMC:使用量子Monte Carlo 计算水分子总能量。
PRIMORDIA:对钷元素61个电子的薛定谔方程求量子解。
MD:对140开尔文温度下216个氩原子进行分子动力学模拟。

功能:(见上)

相关软件:(无)

SIESTA

主页:http://www.uam.es/departamentos/ciencias/fismateriac/siesta/

获得方法:发email给siesta@polar.fmc.uam.es,会把源代码发到你的信箱。其中交换-相关源程序xc.f可以直接下载。

简介:
SIESTA用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟。它在局域密度近似(LDA-LSD)和广义梯度近似(GGA)中使用标准的Kohn-Sham自恰密度泛函方法,除了提供的基组,还可以使用ABINIT的赝势基组。Fortran 77编写,目前还不支持并行计算。

功能:
可以计算总能量和局部能量,原子力,应力张量,电偶极矩,原子、轨道和键的Mulliken布居数分析,电子密度。它还可以计算(某些选项不兼容)恒温分子动力学,可变单元动力学,自旋极化计算,布里渊区域的k取样。

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

SIBFA

主页:(无)

获得方法:直接下载。
http://www.ccl.net/cca/software/SOURCES/FORTRAN/sibfa/

简介:SIBFA是从头计算片断总相互作用代码。它以从头计算为基础,用于描述和校正分子动力学的程序。它用于计算包括有机分子和生物大分子在内的分子内和分子间相互作用。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

SOCJT

主页:
http://molspect.mps.ohio-state.edu/goes/software/socjt/
http://spectroscopy.chemistry.ohio-state.edu/goes/software/socjt/

获得方法:尚在开发中。程序的主要部分直接下载,其余部分与作者联系。

简介:自旋-轨道藕合Jahn-Teller程序。

功能:
对任何非立方点群分子的Jahn-Teller哈密顿量,包含线性和二次项,以及自旋-轨道藕合,寻找最低能量解。
使用本征矢,计算态的大量性质,包括Coriolis藕合常数,以及相关的Jahn-Teller活性态与非简并态或其它Jahn-Teller活性态之间的振动跃迁强度。
提供任意数量的Jahn-Teller活性模式,以及任意的整数或半整数自旋态。
用非线性最小二乘程序拟合实验数据参数。
对线性分子P态使用定制版本的Renner-Teller程序。
用辅助程序e2e和pi2pi计算两个E态或两个P态之间的振动级次跃迁强度。

平台:Cray,MS-DOS

相关软件:(无)

STUTTGART TB-LMTO-ASA

主页:http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/LMTODOC/LMTODOC.html

获得方法:发e-mail给o.jepsen@fkf.mpg.de

简介:线性muffin-tin轨道(LMTO)方法的程序。

功能:(见上)

平台:UNIX

相关软件:(无)

TheRate

主页:http://therate.hec.utah.edu/index.html

获得方法:在线填写注册单,获得密码后下载。

简介:图形用户界面(GUI)软件。它是一个高级研究工具,还可以用作量子化学和动力学课程的直观教学工具。

功能:TheRate由从头计算和/或密度泛函理论的电子结构分子轨道,计算单分子和双分子的气相反应的理论速率常数。当前,TheRate 1.1使用Gaussian 94的输出作为输入,因此必须可以访问Gaussian 94。

平台:Mac OS,Linux,SGI IRIX和Windows。

相关软件:(无)

TIGHTEN

主页:http://www.wsi.tu-muenchen.de/T33/research/Codes/tighten.htm

获得方法:直接下载。

简介:紧密束缚哈密顿量生成程序。

功能:
程序设定经验紧密束缚哈密顿量,用于:
任何用户指定的晶格
任何用户指定的分子
任何紧密束缚矩阵元素的功率法则距离依赖关系
任意数量的第n个相邻晶格相互作用
变形晶格结构
除了每个原子的s,s*(第二个s态),p,d态之外,任意组紧密束缚态
p和d的原子内自旋-轨道藕合
双中心近似

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

***TRITON

主页:http://www.chemi.muni.cz/lbsd/triton.html

获得方法:在线申请,收到有账号和密码的电子邮件后就可下载。

简介:
蛋白质变异模型和评估其活性的X Window图形界面软件。包含MOPAC插件。

功能:
蛋白质变异模型,反应路径计算。

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

TubeGen

主页:http://deaddog.duch.udel.edu/~frey/programming/tubegen/

获得方法:直接下载。

简介:TubeGen使用纳米管手性指数产生分数坐标栅格,用于Gaussian 98和固体电子结构程序WIEN97。TubeGen可以产生平面和旋转栅格。

功能:(见上)

相关软件:(无)

vect

主页:http://www.lcp.u-psud.fr/Pageperso/lauvergnat/vect/vect.html

获得方法:直接下载。

简介:类似于Babel,可以进行不同量化程序间几何结构转换。支持Gaussian92,monstergauss (一个很老的从头计算程序),gamess,molpro,molcas格式。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

VEGA

主页:http://users.unimi.it/~ddl/vega/index.htm

获得方法:直接下载。

简介:类似于Babel,转换分子模型格式的程序,并有显示和分析分子三维结构的功能。

功能:(见上)

平台:IRIX (Silicon Graphics),Windows 9x/NT,Linux,FreeBSD,NetBSD,AmigaOS等。

相关软件:(无)

***WebMO

主页:http://www.webmo.net/

获得方法:在线注册,收到有账号和密码的电子邮件后下载。

简介:WebMO是基于World Wide Web界面的计算化学软件包。它需要安装在一台网络服务器上,并且这台计算机上安装了一些计算化学软件,在客户机上不需要安装软件。演示版每个计算不能超过180 CPU秒,之后会中断。专业版无此限制(但却是商业软件)。支持的浏览器有Netscape 4.07+ (PC, unix),IE 4.0+ (PC, unix)和HotJava 3.0+ (PC, Macintosh)。

功能:
1. 3D java编辑器绘制分子结构,运行计算和观察结果全部在网络浏览器中。
2. 支持的量化软件有Gaussian 94,Gaussian 98,MOPAC,MOPAC 2000和GAMESS

平台:各类Unix/Linux

相关软件:(无)

***WinMOPAC 7.2.1

主页:http://www.psu.ru/science/soft/winmopac/

获得方法:直接下载。

简介:
这可不是商业软件WinMOPAC。它有简单图形界面,同时具有显示分子模型的功能。

功能:
进行半经验计算。

平台:Windows

相关软件:(无)

***XVibs

主页:http://members-http-1.rwc1.sfba.home.net/yeldar/xvibs/

获得方法:直接下载。

简介:分子振动计算的驱动工具。可以自动从Aces2,Gamess,PC Gamess,Gaussian 90/92/95/94/98,ADF,Dalton,Jaguar和MOPAC的计算结果中读取简正模式。输出结果以XYZ格式对每个原子显示简正模式矢量。

功能:(见上)

平台:Unix/Linux

相关软件:(无)

这里是未经整理的免费量化软件。一种情况是作者对软件介绍的太简单,另一种情况是我对这些软件涉及的领域不熟悉。大家感兴趣的话,自己去慢慢研究吧。本页内容的更新不另行通知。

http://www.cineca.it/~acv0/CP/carpar.html
Car Parrinello代码。直接下载。

http://www.rzg.mpg.de/~abs/cp2k/index.html
CP2K。进行固态、液态,分子和生物体系中的原子、分子模拟。方法涉及从密度泛函到参数化的经典成对和多体势能。直接下载。

http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/LMTODOC/LMTODOC.html
STUTTGART TB-LMTO-ASA程序。获得方法:发E-mail给andersen@and.mpi-stuttgart.mpg.de。

http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt26/casino.html
量子Monte Carlo程序CASINO。
量子Monte Carlo方法是处理中等尺寸分子最准确的从头计算方法,也可以处理分子和晶体的激发态。获得量子Monte Carlo程序CASINO,请与作者联系。

http://www.scripps.edu/~nwhite/Biomer/index.html
B程序。
在线java程序,用于建立多核甘酸(DNA/RNA),多聚糖和蛋白质模型,交互式分子编辑器,AMBER力场几何优化,模拟分子动力学退火,并可以保存为gif,jpeg和ppm图像文件。

http://rugmd0.chem.rug.nl/~gmx/features.html
GROMACS。
蛋白质的完全自动拓扑生成器,大量的分析工具:分子动力学,leap-frog积分,定位langevin动力学,简正模式分析,静电,非平衡分子动力学,NOE数据的NMR求精法。

http://comp.chem.umn.edu/omnisol/
OMNISOL
计算包含水和由H, C, N, O, F, S, Cl, Br, I构成的有机分子溶液的自由能。

http://www.pt.tu-clausthal.de/~ptpb
Projector Augmented Wave (PAW)方法。

http://lacebark.ntu.edu.au/j_mitroy/research/atomichf/atomichf.htm
一个计算原子结构的Hartree-Fock程序。

http://www.vuse.vanderbilt.edu/~cff/mchf_collection/
一些对原子结构进行量子化学计算的程序(MCHF & Hartree-Fock)。

http://www.cobalt.chem.ucalgary.ca/ps/symmetry/
Symmetry,一个简单的C++程序,用于分析一组分子坐标的点群对称性。
平台:MS-DOS,Compaq Tru64,SGI IRIX(理论上其它Unix环境不会遇到太大的编译问题)。

http://brian.ch.cam.ac.uk/software.html
一些用于研究原子、分子团簇的程序。

http://www.krl.caltech.edu/~aib/papdat.html
bkmp2,研究H3分子势能曲面的程序。

http://www.dl.ac.uk/TCSC/QuantumChem/quasi_www/manual_2.04/manual.html
http://www.dl.ac.uk/TCSC/QuantumChem/quasi_www/manual/manual.html
ChemShell。Unix/Linux下的图形用户输入界面,支持很多常见的量化程序。

http://www.hep.ph.rhbnc.ac.uk/~blair/detsim/brahms.html
BRAHMS,从头Monte Carlo计算的代码。

http://www.cmmp.ucl.ac.uk/~conquest/
CONQUEST是O(N)密度泛函代码,用于对大量原子进行准确的从头计算。使用Cray T3E的512个节点,可以计算16,384个原子。

http://dft.rutgers.edu/lib/
http://www.physics.rutgers.edu/~happel/lib/
密度泛函Fortran程序库。提供很多DFT代码的子程序,每个子程序都有输入和输出的例子。

http://www.dl.ac.uk/CCP/CCP6/library.html
一些量子化学/量子物理程序代码,直接下载。
abc
——A+BC体系的量子反应散射程序。
EIKONXS
——经典电荷转移轨迹代码。
QUANTXS
——完全两字电荷转移log-导数代码。
SEMICLXS
——用于曲线交叉问题的几个半经典双态近似。
傅利叶网格哈密顿量代码
——对束缚态解薛定谔方程最简单的方法。
含时量子动力学波包代码
——计算双原子分子的光离解。

http://www.mcc.uiuc.edu/SummerSchool/
伊利诺斯大学计算材料暑期学校在线课程。大部分课程都有讲义,演示,练习,以及理论计算代码下载。

http://www.imp.leeds.ac.uk/homes/PH/QWWAD/
一些量子理论计算代码。

http://dft.rutgers.edu/pubs/PBE.asc
密度泛函PBE代码。

http://www.lctn.u-nancy.fr/logiciels.html
LCTN,一些量子化学/分子力学软件。

http://www.ucs.mun.ca/~rpoirier/MUNgauss.htm
Mungauss的主页。

http://www.mpibpc.gwdg.de/abteilungen/071/solvate/docu.html
SOLVATE,分子动力学软件,直接下载。

http://dasher.wustl.edu/tinker/
TINKER,分子动力学软件,直接下载。

http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/
NAMD,分子动力学软件,在线注册后下载。

http://www.tc.cornell.edu/reports/NIH/resource/CompBiologyTools/moil/
MOIL,分子动力学软件,直接下载。

http://www.fos.su.se/physical/sasha/md_prog.html
MDynaMix,分子动力学软件,直接下载。

http://beam.helsinki.fi/~knordlun/mdh/mdh_program.html
MDRANGE,分子动力学软件,直接下载。

http://fulcrum.physbio.mssm.edu/~mezei/index.html
一些分子动力学软件,直接下载。

http://www.fungible.com/fungimol/
Fungimol,分子动力学软件,直接下载。

http://www1.imim.es/modeling/mipsim/
MIPSIM。研究生物分子间的相似性。具有与GAMESS,INSIGHT,gOpenMol等外部程序的接口。

http://www.biochemistry.bham.ac.uk/osmart/hole/
HOLE。Monte Carlo模拟程序。

http://www.tc.cornell.edu/reports/NIH/resource/CompBiologyTools/eceppak
ECEPPAK。全原子的分子力学程序,用于蛋白质和多肽构象性质的建模。

http://mendel.imp.univie.ac.at/SURFACE/ASC/index.html
ASC。结合了确定分子表面的面积和分子力学的代码。

http://www.fysik.dtu.dk/~stoltze/artwork/artwork.html
ARTwork。基于有效媒质理论的分子动力学和Monte Carlo模拟的代码。

http://cmp.ameslab.gov/cmp/CMP_Theory/cmd/alcmd_source.html
AL_CMD。经典的分子动力学代码。

http://www.cs.rice.edu/~ychu/software/geo.html
DP-GEO。一个分子动力学软件。

http://www.mse.ncsu.edu/CompMatSci/code.html
MD。分子动力学模拟代码,用于碳氢化合物,碳,硅,锗以及碳硅锗合金,Lennard-Jones势和束缚键碳势。

http://sites.netscape.net/SparkleMetals
Sparkle。在MOPAC7或MOPAC93中执行的程序,可以用来处理金属。

商业量化软件

ADF 2002

公司主页:http://www.scm.com/

简介:专门作密度泛函计算的软件。包括ADF和BAND两部分,ADF部分的简介见下。BAND部分类似,但专门用于计算周期性体系(晶体,聚合物等)。

功能:

单点计算,几何优化,过渡态,频率和热动力学特性,跟踪反应路径,理论预测化学催化过程,计算任意电子组态,激发能和(超)极化率,使用含时密度泛函(TDDFT)理论(于1999年2002年分别加入到ADF模块和BAND模块中),NMR化学位移,激发能,超极化率,范德瓦尔斯系数,用QM/MM (量子力学/分子力学)混合近似处理大体系环境。ADF使用的全部是Slater型基组,不同于大多数量化软件使用的高斯基组。
应用范围
2002版的基组库包含了Z=1-118号所有元素,而且对常见元素有不同尺寸的基组,从最小的到高质量的,并且对在ZORA近似中的相对论计算和需要附加弥散基函数的响应计算提供了特殊的基组。
模型哈密顿量
–选择一种密度泛函,局域密度近似(LDA)和广义梯度近似(GGA)。LDA包括Xonly,Xalpha,VWN和Stoll修正的VWN;GGA包括Pw91,Blyp,Lb94,以及2002版加入的PBE,RPBE,revPBE等。2002版新加入GRAC和SAOP交换相关势,能够改善LB94和BP的结果。最近流行的Meta-GGA交换相关泛函进行post-SCF处理能够获得标准G2计算的精度,也加入到2002版中。
–自旋:限制或非限制
–相对论效应:标量近似和自旋轨道(双群对称性),使用ZORA(推荐)或泡利原理(以前使用)。
–环境:溶剂影响,均匀电场,点电荷(Madelung场),QM/MM方法
分析
–在化学组成(空间相互作用、泡利排斥、轨道相互作用……)中键能的分解。
–数据的表示(分子轨道系数、穆里肯布居), 按照分子中化学片段的组成以及传统的元素基函数表示。
–原子的电荷由Hirshfeld分析与Voronoi分析,以及经典穆里肯布居决定。

ADF2000的计算结果支持图形显示,需要下载一个自由程序Molden。

平台:Compaq Alpha,HP,NEC IA64,IBM,SGI,PC linux (Pentium III, Pentium IV, Athlons),也可用于MS Windows(需要购买源代码,做特殊设定)。

相关软件:

老版本的ADF2.1和2.3,不知道能不能用。请点击这里下载试试吧。

Xaim
主页:http://www.quimica.urv.es/XAIM/
获得方法:在线填写注册表后下载。
简介:X11图形界面,用于ADF和Gaussian输出文件的分子中原子类型的分析。
平台:所有支持X11窗口的Unix平台。

三个ADF的图形用户界面:

1. ADF-Cerius2
说明:商业软件,仅用于SGI平台。图形界面的详细信息见这里

2. Varuna
说明:用于Windows客户机上的ADF图形用户界面,可以编写ADF输入文件,通过和安装ADF的主机通信进行计算。成为ADF的用户后就能下载。它还提供到ChemOffice 2000的接口,用于分析结果。还具有理论预测红外-拉曼,可见-紫外光谱的功能。可以看这里:Varuna界面和预测的光谱

3. DFT Calculation
说明:Windows版ADF,包含ADF2.0.1内核,图形界面,输入菜单并没有包含ADF的全部功能,需要手动修改input文件。需要的话请和我联系

Cache 5

公司主页:http://www.cachesoftware.com/cache/index.shtml

简介:
Cache是用于生命科学、材料和化学的计算机辅助化学建模软件包,适用于实验化学家,生物化学家,药物化学家,计算化学研究者,以及高等教育工作者。Cache使用经典和量子力学方法,并有Dgauss的图形界面,可以使用密度泛函理论进行计算。它包含很多新的半经验方法,可以计算直到20,000个原子的分子,甚至可以挑战实验精度。

功能:
1. 药物设计。在几分钟内预测分子的活性,结构,和ADME性质;添加结构;蛋白质配合基;研究三维构型;研究酶的机制;手性设计;构像搜索,预测溶解度。
2. 反应与合成。预测热动力学和动力学;消除副反应;寻找过渡态;从X-射线结晶图显示结构;寻找催化路径。
3. 化学设计。使用Cache预测任何化合物的性质;研究三维构造;预测IR和UV-可见光谱;预测NMR和振动光谱;研究有机金属;构造和显示晶体;测量两个分子重合的RMS性质。
4. 多聚物。预测Tg,溶解度,内聚能,摩尔体积;预测热脱水。
5. 新增PM5哈密顿量,较AM1,PM3,和MNDO这些方法,在热构成计算上能提高四倍精度。
6. 最新版本支持所有的主族元素。
7. AM1-d方法支持过渡金属:Pt, Fe, Cu, Ag, Mo, V和Pd。
8. 全部计算都在图形界面中。

平台:Windows 95/98/NT4/2000/ME,Macintosh。

ChemOffice

公司主页:http://www.camsoft.com/

简介:其中的Chem3D Ultra支持Gaussian98W,MOPAC计算,2001版新增加了GAMESS(USA)支持(需下载GAMESS插件)。主页同时提供下载。ChemOffice的详细中文信息可见http://chemsoft.363.net/china2000.htm

平台:Windows

GAMESS-UK

公司主页:http://www.dl.ac.uk/CFS/

简介:(见下)

功能:
Hartree-Fock
密度泛函,包括B3LYP,BLYP,BP86,BP97,B97,HCTH和LDA
电子相关,包括MP2,MP3,MCSCF,CASSCF,MR-DCI,CCSD,CCSD(T),RPA和MCLR的激发能和谐振强度,完全CI,Green函数计算电离势。2002年的新版本6.3还可以进行多参考Moller-Plesset微扰理论计算
直接方法,有直接SCF,DFT,MP2,RPA,半直接MRDCI
分子特性,包括Mulliken和Lowdin布居数分析,静电势导出电荷,分布式多极矩分析,Morokuma分析,自然成键轨道(NBO)分析,到AIMPAC代码的接口,红外和拉曼强度,多极矩,极化率,超极化率,磁化率,ZORA相对论影响,溶剂影响DRF
赝势,包括局域和非局域赝势
可视化,进行前期和后期处理
混合QM + MM,具有到Charmm的接口
半经验方法MNDO,AM1和PM3

平台:Cray,Fujitsu,HP,IBM,Compaq/DEC,SGI,Sun,PC Linux/FreeBSD/WindowsNT。

Gaussian 

公司主页:http://www.gaussian.com/

简介:Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究:
分子能量和结构,过渡态的能量和结构,化学键以及反应能量,分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷和电势,振动频率,红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径。
计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态。Gaussian是研究诸如取代效应,反应机理,势能面和激发态能量的有力工具。

平台:各类Unix/Linux,Windows

资源:

请看starl节译的《Exploring Chemistry with Electronic Structure Methos》(第二版),量子化学计算和使用Gaussian入门的好帮手。

《Gaussian使用经验谈》,是我使用G98W计算分子电子态时遇到的一些具体问题。最近做了一点补充。

《Gaussian98高级注释》

320个G94各类输入文件的例子,目录

G94关键字定义说明(中文,不全,只有字母P开头以后的部分),需要的话请和我联系

G98W与PC GAMESS计算执行情况的详细比较

相关软件:

Xaim
主页:http://www.quimica.urv.es/XAIM/
获得方法:在线填写注册表后下载。
简介:X11图形界面,用于ADF和Gaussian输出文件的分子中原子类型的分析。
平台:所有支持X11窗口的Unix平台。

***CP-Optimizer
主页:http://stark.udg.es/~perico/bbopt.html
获得方法:直接下载。
简介:利用Gaussian软件包自动进行几何优化和谐振频率计算。
功能:
单点CP修正能量计算。
使用数种优化方法进行分析CP修正优化。
CP修正谐振频率计算。
使用分子对称性减少计算量。
平台:SGI,IBM和PC linux

***Gabedit
主页:http://lasim.univ-lyon1.fr/allouche/gabedit
获得方法:直接下载。
简介:Gabedit是MOLPRO 2000和Gaussian 98的图形输入界面,兼有显示分子图形的功能。
功能:(见上)
平台:Linux,Windows 98/NT/2000

***GabView
主页:http://hplasim2.univ-lyon1.fr/allouche/gabview/
获得方法:直接下载。
简介:Gabview是分子电子结构后期处理程序,从MOLPRO或GAUSSIAN的输出结果显示分子轨道,电子密度,同时支持Molden和GabView格式的文件。需要先安装上面的Gabedit。
功能:(见上)
平台:Windows,Unix/linux

KMovisto
主页:http://members.tripod.de/PageOfMH/index.html
获得方法:直接下载。
简介:用于量子化学的分子浏览器。程序读取UNIX或MS Windows系统获得的GAUSSIAN 94和GAUSSIAN 98文件,或者xyz文件,用球模型和棍模型画分子图。
功能:(见上)
平台:Linux。

HyperChem 7

公司主页:http://www.hyper.com/

简介:图形界面,有半经验方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI和7.0版新增加的密度泛函。可进行单点能,几何优化,分子轨道分析,预测可见-紫外光谱,蒙特卡罗和分子力学计算。主页同时提供试用版下载。

平台:Windows

资源:

HyperChem的中文使用说明(部分):请点击这里

HyperChem除主页之外的另一个下载站点:请点击这里

Jaguar

公司主页:http://www.schrodinger.com/Products/jaguar.html

简介:(见下)

功能:
并行计算
能运行在大多数共享内存的平台上,还可用在IBM SP2上。
波函和能量
限制和非限制的Hartree-Fock(RHF,UHF,ROHF)
Mφller-Plesset二级微扰理论(MP2),包含冻结核选项
局域Mφller-Plesset二级微扰理论(LMP2),包含冻结核选项,和对闭壳层和开壳层的“局域局域”MP2
对过渡态和芳香环系统的LMP2计算,自动去局域化
波函的Pipek-Mezey或Boys局域化
密度泛函理论(DFT),包括限制和非限制DFT
用于大规模DFT计算的快速多极方法
用于开壳层和闭壳层的广义价键(GVB),最多50个GVB对。
用于开壳层和闭壳层的GVB-RCI(限制组态相互作用)
GVB-LMP2多参考微扰理论;局域-局域GVB-LMP2
GVB-DFT (GVB波函的post-SCF DFT能量求值)
分子波函和能量,最多5000个基函数
用快速赝势积分技术,研究包含镧系元素的体系
平衡计算
对有机金属体系,自动进行高质量的波函初始猜测
溶剂物的计算
对电介质界面使用分子表面,进行自恰量子化学反应场计算
溶质的HF,DFT,LMP2或GVB波函
溶液系统的电荷拟合,多极矩,频率,极化率,超极化率,以及其它特性
多个片断的溶液模拟
几何优化,导数,频率,和过渡态
使用HF,DFT,LMP2或GVB的分析梯度,优化分子结构
过渡态优化
HF,DFT,LMP2或GVB波函的溶液相位结构或过渡态优化
笛卡尔坐标或内坐标的优化
自动产生内坐标(Z-matrix)
束缚几何优化;动态几何结构限制
对所有的优化计算默认使用冗余内坐标
HF,DFT,LMP2或GVB的频率计算(使用二阶导数),用于气相或溶液
SQM方法用于振动频率的经验定标
寻找全部过渡态的功能
势能曲面扫描
基组
STO-3G,3-21G,4-21G,6-21G,4-31G,6-31G,6-311G,D95V,D95,MSV,cc-pVDZ,以及cc-pVTZ基组,包含f函数,以及极化和弥散函数选项
有效核势(ECP)基组,对过渡金属使用Hay-Wadt ECP,镧系金属使用Cundari-Stephens ECP
其它分子特性
拟合ESP电荷的高级方案
多极矩(一直到十六极)
藕合微扰Hartree-Fock (CPHF)极化率和超极化率张量
红外(IR)强度
整个体系或部分结构的振动光谱
热化学特性
同位素影响
Mulliken布居数和Mulliken自旋布居数分析
对一个栅格输出轨道、电子密度和势
Frank Weinhold最后版本的NBO分析
分子重量和计算
算法和收敛方法
赝光谱和所有的分析方法
DIIS方法,GVB-DIIS (对GVB和其它计算)
对过渡金属和GVB计算,自动进行高质量的波函初始猜测和快速收敛算法
自动识别和使用分子点群对称性,包括非阿贝尔点群
输入和输出文件格式
MacroModel,BIOGRAF,和GAUSSIAN文件输入选项
输出选项,产生MOLDEN,gOpenMol,GAMESS,SPARTAN,MacroModel,GAUSSIAN,DelPhi,Grasp和Xmol输入文件
使用Babel程序的其它选项
自动生成Jaguar restart文件,可以很容易地重新提交任务
友好的任务提交和管理程序
易用的脚本语言,用于设置复杂的计算实验
直接到MOPAC的界面
图形用户界面(GUI)和用户指南
上面列出的功能可以很容易地从图形用户界面选择
在工作站和X终端的分子图形显示,使用原子符号,GVB对选项,以及其它显示功能
GUI显示反应物,产物和过渡态结构
GUI操纵单个任务或复合任务
报告生成工具,用于从输出文件中提取数据
用户指定溶剂,电介质边界,定义DFT混合,输出选项,远程任务提交,以及其它特性
250页的用户指南,包含完整的索引,以及GUI的在线帮助

平台:Unix/Linux

MOLCAS

主页:http://www.teokem.lu.se/molcas/

获得方法:在线填写订货单。

简介:对分子基态和激发态进行MP2,SEWARD,CASSCF,CASPT2,藕合簇等计算。这并不是一个“黑箱”工具。要求用户应当受过量化方面的训练,对当今流行的一些量化模型有些了解。当前版本是MOLCAS-5。

功能:
MOLCAS-5的RAS态相关方法(RASSI)中,新增加了自旋-轨道藕合计算。它允许计算势能曲面的自旋-轨道分裂,磷光寿命,等等。MOLCAS现在结合了Douglas-Kroll标量相对论修正,可以研究包括重金属原子(例如镧系和锕系)的体系。
其中的CASPT2程序增加了多重态特性,可以使不同的态在有关的理论级别上相互作用。现在可以进行相当大的计算(大基组,大体系,等)。
包含了价键计算程序CASVB。
结合了到ACES-2的界面,可以和该代码的全部藕合簇特性一起使用。
包含了MOPAC,HONDO等的功能。
Cerius2系列的图形用户界面C2MOLCAS。

平台:UNIX/LINUX

MOLPRO

主页:http://www.tc.bham.ac.uk/molpro/

获得方法:通过普通信件、传真、电子邮件发送申请信。

简介:国际上广泛使用的专业量化计算软件,速度比Gaussian98要快,而且收敛效果也比Gaussian98好。

功能:
生成收缩高斯基函数(s,p,d,f,g,h,i……)
有效核势
多种单电子特性,如Lx2,Ly2,Lz2,LxLy……等
闭壳层和开壳层(自旋限制和非限制)自恰场
各种修正交换和相关势梯度的密度泛函理论
多重组态自恰场,即二次收敛MCSCF方案
多重参考组态相关
多重参考二级、三级微扰理论(MR-PT2, MR-PT3)
Møller-Plesset微扰理论(MPPT),藕合簇(CCSD),二级组态相关(QCISD)和闭壳层体系的Brueckner藕合簇(BCCD)
开壳层藕合簇理论
完全组态相关
SCF,DFT,态平均MCSCF/CASSCF和MP2波函的分析能量梯度
分析MCSCF的非绝热藕合矩阵元素
能量优化价键波函和CASSCF波函的价键分析
MCSCF和MRCI波函的单电子跃迁特性,包括自旋-轨道藕合
MCSCF波函的一些双电子跃迁特性
布居数分析
轨道定位
分布多极分析
自动几何优化
自动计算振动频率,强度和热动力学特性
跟踪反应路径
几何输出有xyz,MOLDEN和Gaussian格式;分子轨道和频率输出为MOLDEN格式

相关软件:

***Molden
主页:http://www.caos.kun.nl/~schaft/molden/molden.html
获得方法:直接下载。
简介:X Window窗口程序,图形显示计算结果。
平台:各类Unix/Linux

***Gabedit
主页:http://lasim.univ-lyon1.fr/allouche/gabedit
获得方法:直接下载。
简介:Gabedit是MOLPRO 2000和Gaussian 98的图形输入界面,兼有显示分子图形的功能。
功能:(见上)
平台:Linux,Windows 98/NT/2000

***GabView
主页:http://hplasim2.univ-lyon1.fr/allouche/gabview/
获得方法:直接下载。
简介:Gabview是分子电子结构后期处理程序,从MOLPRO或GAUSSIAN的输出结果显示分子轨道,电子密度,同时支持Molden和GabView格式的文件。需要先安装上面的Gabedit。
功能:(见上)
平台:Windows,Unix/linux

MOPAC2000

公司主页:http://venus.netlaboratory.com/material/messe/winmopac/home-e.html

简介:
MOPAC是世界上最广泛使用的半经验量化程序,用于研究气体,溶液和固体的化学特性,包括Gibbs自由能,活化能,反应路径,偶极矩,非线性光学特性以及红外光谱,等。它还可以用做为结构-特性(或活性)定量的基础,预测生物学及其它特性,包括致癌性,蒸汽压,水溶解性,反应率等。MOPAC 2000中获取专利的MOZYME算法可以使那些在超级计算机上需要几天或者几周的计算,在PC机上仅需要几分钟。对于包含上千原子的体系,诸如蛋白质,聚合物,半导体和晶体,它们的电子特性计算仅仅需要几分钟或几小时。MOPAC目前最高的版本是MOPAC 2002(v3.0)。Windows版和Linux版是图形界面。

功能:
1. 计算方法有:在MOPAC中有:AM1,AM1-d,PM3,MNDO,MNDO-d,MINDO/3;在MOS-F中有:CNDO/2,CNDO/S,CNDO/S2,CNDO/S3,INDO/S。
2. 可以进行的计算有:几何优化,过渡态结构,激发态结构,线性比例SCF计算(MOZYME方法),反应坐标能量图,热构成(气相或溶液),简正模式振动分析,溶剂特性(气相,水,辛醇,等),IR光谱,原子电荷,极化率,偶极矩,分子轨道,电子密度,梯度范数,力,能量分配,ESP原子电荷,键序,参量化分子静电势,体系间交叉结构,氨基酸片断顺序的结构分析,IRC/DRC。
3. 支持的输入文件格式:MOPAC,MOS-F,Gaussian输入文件(*.gjf),Gaussian fchk文件(*.fch),Cartesian文件(*.car),PDB。
4. 3D结构构造和显示分子。
5. 限制:WinMOPAC 3.0 Pro:20,000个原子;WinMOPAC 3.0:200个原子。
6. 工具程序:MAKPOL(用于构建晶体模型),BZ(用于计算键结构)。

平台:Windows NT4.0/95/98,DOS,Linux/Unix。

PCMODEL

公司主页:http://www.serenasoft.com/

简介:图形界面程序,利用MOPAC进行半经验计算,并具有显示分子模型的功能。支持多种量化程序的输入格式。现在是7.5版。国内有Windows破解版(6.0)下载(可用搜索引擎查找)。

平台:Windows NT/95/98, MacOS和Linux

PC SPARTAN

公司主页:http://www.wavefun.com/

简介:图形界面。包含从头Hartree-Fork和MP2方法,密度泛函(局域VWN计算),半经验方法(MNDO,MNDO(d),AM1,PM3)等。可进行单点能,几何优化,组态分析,蒙特卡罗和分子力学计算。

平台:Windows

资源:

《利用SPARTAN图形接口准备Gaussian94输入文件》(中文),见资源下载区。

PQS

公司主页:http://www.pqs-chem.com/

简介:并行量化计算软件,提供试用版下载ftp://pqs-chem.com/(当然有些功能没有),注册后运行。

功能:
闭壳层和开壳层SCF和DFT能量、梯度计算。
交换-相关泛函有:VWN局域相关,Becke 88非局域交换,Lee-Yang-Parr非局域相关,B3-LYP等。
使用上面所有方法的几何优化,包括能量最小值和鞍点寻找,
使用上面所有方法的二级导数,用于计算振动频率,IR强度和热动力学分析。
闭壳层Hartree-Fock波函的分析二级导数(开壳层和DFT在开发中)。
闭壳层HF和DFT波函的核磁屏蔽。
单点MP2和双基MP2能量(完全并行化)
势扫描,包括扫描和对所有剩余变量进行优化。
反应路径。
布居数分析。
Weinhold的自然键序分析,包括自然布居数和空间分析。
初步的特性模块,包括电荷,自旋密度,核的电场梯度。
极化率和极化率导数(对拉曼强度)
在几何优化,振动频率与核磁屏蔽中引入外场。
有效的矢量化高斯积分包,允许使用高角动量基函数和常规的收缩基。
使用阿贝尔点群对称性;可以对几何优化使用完全点群对称性(直到Ih)
完全半经验包,用于开壳层(非限制)和闭壳层能量与梯度,包括MINDO/3,MNDO,AMI和PM3。对于后者,到第四行的所有主族元素(除了稀有气体)以及锌和镉,已经实现参数化。
使用Sybyl 5.0力场的分子力学。
使用ONIOM方法的QM/MM。
使用简单Verlet算法的分子动力学。
Pople型输入,用于快速产生输入,并与其它程序兼容。
图形化输入生成器。
所有主要的从头计算功能均实现并行化。
PQS可以支持第三方量化软件。目前支持的有:ADF, Molpro, PCModel

平台:Windows NT/95,Linux,IBM AIX

WIEN 2000

公司主页:http://www.wien2k.at/

简介:用密度泛函理论计算固体的电子结构。它基于键结构计算最准确的方案——完全势能(线性)增广平面波((L)APW)+局域轨道(lo)方法。在密度泛函中可以使用局域(自旋)密度近似(LDA)或广义梯度近似(GGA)。WIEN 2000使用全电子方案,包含相对论影响。

功能:
计算固体特性。键能和态密度,电子密度和自旋密度,X射线结构因子,Baders的“分子中的原子”概念,总能量,力,平衡结构,结构优化,分子动力学,电场梯度,异构体位移,超精细场,自旋极化(铁磁性和反铁磁性结构),自旋-轨道藕合,X射线发射和吸收谱,电子能量损失谱
计算固体的光学特性
费米表面
LDA,GGA,meta-GGA,LDA+U,轨道极化
中心对称和非中心对称晶格,内置230个空间群
图形用户界面和用户指南
友好的用户环境W2web (WIEN to WEB)可以很容易的产生和修改输入文件。它还能帮助用户执行各种任务(如电子密度,态密度,等)。

平台:IBM RS6000,HP,SGI,COMPAC-alpha,SUN,PC Linux

计算化学链接

http://www.chemie.unibas.ch/~vogtp/maple/
http://www.chemie.unibas.ch/PC/Huber/maple.html
http://www.mapleapps.com/categories/science/quantum/quantum.html
http://www.adeptscience.co.uk/products/mathsim/maple/apps/categories/science/quantum/quantum.html
几个做简单量子力学/量子化学计算的Maple程序。需要安装Maple才能运行。
http://www.chem.ac.ru/Chemistry/Soft/
化学软件网址列表。
http://antas.agraria.uniss.it/software.html
化学软件列表和FTP站点列表。
http://bogense.chem.ou.dk/~icc/software.html
计算化学软件相关的网址。
http://www.lctn.uhp-nancy.fr/Chercheurs/Xavier.Assfeld/links.html
量化软件,基组库,量化教学。
http://www.sc.ehu.es/powgep99/dcytp/teoricos/txoni/programak.htm
量子化学软件和其它有用的应用程序。
http://www.iupac.org/reports/1996/6802brown/
量子化学缩写辞典。
http://ftp.nchc.gov.tw/pub/
台湾高速电脑中心各学科领域研究软件,可以下载。包括Chemistry,databases,parallel,physics,visualization。
http://www.clarkson.edu/~pac/reps.html
Clarkson大学相对论有效势数据库。提供第二至第六周期全部元素的相对论有效势基组下载,可以用在Gaussian和COLUMBUS上。
http://www.pnl.gov/quantum/
有Dyall博士的《相对论量子化学》授课笔记下载,即将出书。
http://www.ccl.net/
Computational Chemistry List,有免费量化软件下载,以及量子化学论坛等。
http://www.scm.com/Doc/publist.html
与ADF软件有关的一些博士论文。从中可以学到很多量化知识。
http://leroy.uwaterloo.ca/
处理双原子分子光谱参数的一些fortran源程序(LEVEL,BCONT,RKR1,DSParFit)。申请后,就会发到你的E-mail信箱。
http://zeus.polsl.gliwice.pl/~nikodem//linux4chemistry.html
集中了绝大多数用在Linux下的化学软件。
http://www.ghpcc.gzu.edu.cn/
贵州大学高性能计算化学实验室,提供Gaussian94的Hartree-Fock,DFT,Moller-Plesset微扰和半经验量子化学在线计算。
http://www.chpcc.edu.cn/mulliken/index.html
清华大学高性能计算中心提供的Mulliken远程登录计算。
Mulliken是由IBM公司开发的一个可用于化学、医学、制药、生物等应用领域的软件,基于并行算法,户可以充分利用并行计算优势。用户只需简单地在已设计好的图形用户视窗界面上输入计算选项和参数,Mulliken就会自动把作业拆分到各个节点上去运行。Mulliken的基组函数丰富,作业递交简单明了,数据处理直观。
Mulliken可以处理的分子性质包括能量、生成热、离子势、电子亲和力、平衡构型、过渡态构型、活化能、反应路径、红外光谱、多极矩、静电势、可极化性以及原子电荷。在计算宏观性质时的主要对象是溶液,这些性质包括热容、可压缩性、径向分布函数、溶剂化自由能、蒸汽压、差分溶剂化自由能、分配系数和扩散系数。
http://linus.chem.wesleyan.edu/icc/
一些量子化学计算的实验。
http://theo1.theochem.tu-muenchen.de/qcl/info/welcome_fe.html
一些量子化学计算的练习(需要注册获得账号密码)。
http://www.cobalt.chem.ucalgary.ca/ziegler/Lec.chm373/lectures.html
2001年计算化学冬季课程。从原子物理、光谱学,到量子化学的基础知识都有,可以下载很多PowerPoint、PDF文件。
http://202.206.106.100/qc/lzhx-0.htm
河北师范大学计算量子化学研究所蔡新华教授的量子化学在线教学。结构为:
绪论,量子力学基础,原子结构,分子结构,量化程序应用。
其中,量化程序应用一章包含详细的Gaussian98W和Hyperchem应用图示。
http://allserv.rug.ac.be/~tkuppens/chem.shtml
网上免费化学软件资源。按字母顺序排列,并允许访问者添加新软件。
http://chem.yonsei.ac.kr/~lsk/software.html
化学软件。
http://www.acm.org/calgo/contents/
各种算法的程序。
http://www.emsl.pnl.gov:2080/proj/crdb/
EMSL计算化学结果数据库,察看用各种理论、各种基组计算出的结果。255种分子,41种Atoms,37,071项数据。
http://www.ccl.net/cca/documents/dyoung/topics-orig/
David Young的计算化学专题文章。
http://www.webelements.com/
元素周期表。
http://www.cpc.cs.qub.ac.uk/cpc/
著名的物理和物理化学程序库,需要交钱注册才可以下载。
http://zarbi.chem.yale.edu/products/
一些化学软件。其中有些是免费下载的。
http://users.unimi.it/~ddl/other_projects.htm
一些自由下载的化学软件,包括半经验量化计算程序MoPac 5.00和预测蛋白质结构的PREDATOR等。
http://pcgate.thch.uni-bonn.de/tc/grimme/vdftci/vdftci.html
对分子激发态使用组态相关的密度泛函计算。
http://www.emsl.pnl.gov:2080/forms/basisform.html
著名的基组库。
http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt26/RHF.TABLES.txt
ROOTHAAN-HARTREE-FOCK基态的原子波函。包括原子序数Z=2-54的Slater型轨道展开和期待值。
http://www.chem.uni-potsdam.de/linkcenter/download.html
PC机化学软件下载站点。
http://www.smps.ntu.edu.au/chem_ref.html
网上的计算化学资源。
http://www.infochembio.ethz.ch/cheminfo/TheoretChemie.html
理论化学网络资源。
http://saturn.nchc.gov.tw:9091/soft_doc/
量化、分子模型软件信息,包含G98中文使用说明。但是大部分无权访问。请与作者联系。
http://www.chem.swin.edu.au/modules/
计算化学模型。简要介绍了半经验方法、从头计算方法、分子力学和分子动力学的理论和应用,以及Gaussian和Gamess的使用。在Direct use of interfaces中,包含MOPAC,Gaussian94,GAMESS在线计算。
http://dft.rutgers.edu/lib/
http://www.physics.rutgers.edu/~happel/lib/
密度泛函Fortran程序库。提供很多DFT代码的子程序,每个子程序都有输入和输出的例子。
http://www.fz-juelich.de/nic-series/
量化理论文章(第一至第三卷),PDF和PS格式。其中,第一卷和第三卷内容相同,第二卷只有摘要。
http://www.chem.ac.ru/Chemistry/Soft/SEARCH.en.html
计算化学资源。
http://www.mcc.uiuc.edu/SummerSchool/Richard%20Martin/martin.htm
密度泛函理论在线教程。
http://www.mcc.uiuc.edu/SummerSchool/
伊利诺斯大学计算材料暑期学校在线课程。大部分课程都有讲义,演示,练习,以及理论计算代码下载。
http://www.imp.leeds.ac.uk/homes/PH/QWWAD/
一些量子理论计算代码。
http://vchihaia.tripod.com/ASM.html
计算化学方面的资料。
http://webbook.nist.gov/chemistry/
美国国家标准技术研究所主页(化学类),可以查找包括光谱在内的一些信息。
http://sdpd.univ-lemans.fr/museum/
结晶学源代码博物馆,提供1960年至今相关源代码下载。
http://www.qchem.pnpi.spb.ru/publication/recp.html
有效核势库。不过内容比较少。
http://www.adi.uam.es/Docs/Knowledge/Fundamental_Theory/theory.html
量化的一些基本理论
http://www.nchc.gov.tw/chinese/07_publication/nchcs/search.html
G94中文简介和关键字,其中关键字缺少一部分(BIG5)。

weinxin
扫码,关注科塔学术公众号
致力于成为国内领先的科研与学术资源导航平台,让科研工作更简单、更有效率。内容专业,信息准确,更新及时。
avatar