GoPubMed

GoPubMed

文献分析工具，对PubMed检索结果进行探索、分析的工具

GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作开发的一个文献分析工具，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。

基本信息

详细介绍

GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件.通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间.检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等。

主要优势

1.与PubMed同步；

2.关键字选择简便；

3.有多种直观的分析图；

4.方便找到关键性的创新点。

发展历史

GoPubMed是一个基于知识的生物医学文本搜索引擎。 基因本体论（GO）和医学主题词（MeSH）用作“目录”，以便构建MEDLINE数据库的数百万篇文章。 MeshPubMed曾经是一个单独的项目，但现在已经合并了两个。

GoPubMed中使用的技术是通用的，通常可以应用于任何类型的文本和任何类型的知识库。该系统由Michael Schroeder和他在Transinsight的团队在德累斯顿工业大学开发。

GoPubMed.com是生命科学的语义搜索引擎，已经被2009年红点认可：最佳的通信设计类别 - 图形用户界面和交互式工具。 Transinsight因其在CeBIT 2011上的企业语义智能的杰出发展而获得德国创新奖IT的认可。

工作原理

当人们搜索时，他们会考虑问题。 GoPubMed允许通过使用背景知识显着更快地找到所需的信息。 GoPubMed为您的搜索查询检索PubMed摘要，从摘要中的基因本体论（GO）和医学主题词（MeSH）中检测术语，显示与关键字相关的GO和MeSH的子集，以及允许您浏览本体并仅显示包含特定GO和MeSH术语的论文。

执行搜索后，生成的摘要将使用您的查询关键字以及GO和MeSH术语进行注释。摘要使用GO和MeSH术语进行分组，这些术语出现在文本中。现在，GO和MeSH层次结构可用于系统地探索搜索结果。

请注意，只有所有GO和MeSH术语的子集可能与您的查询相关。这个子集 - 更频繁的术语 - 显示在左侧。将文档分类到高度组织的网络有助于显着地找到相关文档。内容的层次结构显示了整个GO和MeSH本体。 GO和MeSH作为目录，以构建MEDLINE数据库的1600多万篇文章。

使用方法

打开GoPubMed首页，输入lung cancer

出现如下检索结果,左边会提供高相关性推荐等内容

点击statistics可以查看相关柱状图分析：

注：分析包括：年份、国家、城市、杂志、细分领域、作者等排名信息

年度发表对比情况

世界地图显示分布情况

作者关系网

详细使用说明，请参见附加资料。

附加资料

数据库-(NCBI和GoPubMed)

参考资料

GoPubMed Help