PubMed实用技巧|PubMed、PMC、MEDLINE再也不会傻傻分不清

2018年9月10日16:59:49来源:科研时间PubMed实用技巧|PubMed、PMC、MEDLINE再也不会傻傻分不清已关闭评论2,599 views 2058字阅读6分51秒

我们刚接触生物医药文献检索的时候,面对PubMed、PMC(PubMed Central)和MEDLINE,经常会产生以下疑惑:

  • 它们到底有什么区别和联系?
  • 它们的收录范围有什么区别?
  • 它们的检索词有什么各自特点?
  • 为什么检索结果数量不同?
  • 平时检索时候用什么数据库更方便?

……

一、PubMed、PMC和MEDLINE到底有什么区别和联系?

PubMed诞生于1996年。作为目前最常用的文摘型数据库,PubMed迄今为止已经收录了超过2500万条文献记录。其收录范围不仅包括Medline,还有即将收录至Medline的处理中数据、期刊被Medline收录但是文章已经优先出版的文献、生命科学期刊出版商提交到PMC的文献、NIH基金资助作者的文献和NCBI书籍等。PubMed还提供链接到文献全文所在网站的全文链接。

久负盛名的MEDLINE始建于1966年(追溯收录至1946年),是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)期刊文献记录数据库。目前为止,MEDLNE已经收录超过5600种生物医学及生命科学相关学术期刊,文献记录数量逾两千万条。1983年,MEDLINE推出电子版,网上数据每日更新,光盘版每月更新。MEDLINE有严格的文献选择委员会(the Literature Selection Technical Review Committee ,LSTRC)进行选刊,选刊标准基于MEDLINE选刊指南,包括原创性、科学性及全球读者重要性等方面。目前MEDLINE的文献都收录在PubMed中。

PMC全称为PubMed Central,建立于2000年,由NCBI进行管理,是可以免费获取全文的生物医学和生命科学全文数据库,保存了NLM收录印刷杂志的电子副本。PMC的核心原则是开放获取全文。PMC并不出版文献,而是收集参与杂志及符合研究资助条件的作者提交文献全文。

二、PubMed、PMC和MEDLINE收录范围有什么区别和联系?

PubMed实用技巧|PubMed、PMC、MEDLINE再也不会傻傻分不清
图1. PubMed、PMC和MEDLINE收录范围图示

PMC的绝大部分文献都能在PUBMED中搜索到,只有一小部分图书评论(book reviews)是没在pubMed收录范围内的。

三、PubMed、PMC和MEDLINE检索词有什么各自特点?

MEDLINE支持主题词检索、字段限定检索、截词检索和自由词检索,需要检索人员根据需要人工选定合适的检索方式进行检索。PubMed不仅具有MEDLINE的检索方式,还可以执行自动匹配(Automatic Term Mapping,ATM)。PMC也可以进行PubMed一样的主题检索、自动匹配检索(ATM)等,但是PMC由于收录了全文, 可以额外进行全文检索。

四、PubMed、PMC和MEDLINE为什么检索结果数量不同?

  • 在PubMed中自由词检索时,会检索整个PubMed的收录范围,其范围大于MEDLINE。尤其是会有新近半年被收录的文献记录并未被标注MESH,此时只能用自由词检索到。
  • 当在PubMed中限定MESH词或MEDLINE子集时,其检索结果只会显示MEDLINE的数据。
  • PubMed收录范围是包括Medline和PMC数据的,但是我们使用自由词检索的时候PMC的检索结果反而更多,这是为什么呢?因为PMC收录了全文, 可以额外进行全文检索,所以检索结果较多,这也导致了PMC查准率较差。

五、PubMed、PMC和MEDLINE,我们该用哪个?

综上所述,三者特点比较如表1。最适于使用的还是PubMed,其无愧于当今世界查找生物医药文献利用率最高的数据库。

表1. PubMed、PMC和MEDLINE的特点总结

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六、访问方式:

PubMed:使用下列网址都能访问到

http://www.pubmed.com

http://www.pubmed.org

http://www.pubmed.gov

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Medline:可以在pubmed中限定medline子集。在web of science平台、embase数据库、ovid平台也能检索到medline的数据。也可以使用medline光盘版。

PMC地址:

http://www.pubmedcentral.com

http://www.pubmedcentral.org

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

参考文献:

  1. https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/medline.html
  2. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/about/intro/
  3. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3825/
  4. 崔雷等.《临床信息管理》. 人民卫生出版社 . 2014
  5. http://www.ihep.ac.cn/library/lanmu/library/lanmu/daohang/pubmed.htm
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