教育部包括部本级、教育部离退休干部局、75 所直属高校以及 38 个直属单位。
| 序号 | 单位名称 | 序号 | 单位名称 |
| 1 | 教育部本级 | 59 | 东北林业大学 |
| 2 | 教育部离退休干部局 | 60 | 上海财经大学 |
| 3 | 四川大学 | 61 | 中国矿业大学 |
| 4 | 兰州大学 | 62 | 中国矿业大学（北京） |
| 5 | 中山大学 | 63 | 河海大学 |
| 6 | 武汉大学 | 64 | 南京农业大学 |
| 7 | 复旦大学 | 65 | 中国药科大学 |
| 8 | 南京大学 | 66 | 中国地质大学（武汉） |
| 9 | 厦门大学 | 67 | 中国地质大学（北京） |
| 10 | 山东大学 | 68 | 华中农业大学 |
| 11 | 中国海洋大学 | 69 | 电子科技大学 |
| 12 | 北京大学 | 70 | 西南交通大学 |
| 13 | 中国人民大学 | 71 | 西南财经大学 |
| 14 | 南开大学 | 72 | 西安电子科技大学 |
| 15 | 吉林大学 | 73 | 北京交通大学 |
| 16 | 重庆大学 | 74 | 中南财经政法大学 |
| 17 | 西安交通大学 | 75 | 长安大学 |
| 18 | 华南理工大学 | 76 | 对外经济贸易大学 |
| 19 | 华中科技大学 | 77 | 华北电力大学 |
| 20 | 武汉理工大学 | 78 | 教育部机关服务中心 |
| 21 | 合肥工业大学 | 79 | 国家教育行政学院 |
| 22 | 上海交通大学 | 80 | 国家开放大学 |
| 23 | 同济大学 | 81 | 中央电化教育馆 |
| 24 | 华东理工大学 | 82 | 中国教育电视台 |
| 25 | 东华大学 | 83 | 教育部语言文字应用研究所 |
| 26 | 东南大学 | 84 | 国家留学基金管理委员会 |
| 27 | 江南大学 | 85 | 中国教育国际交流协会 |
| 28 | 浙江大学 | 86 | 国家汉语国际推广领导小组办公室 |
| 29 | 湖南大学 | 87 | 教育部教育管理信息中心 |
| 30 | 中南大学 | 88 | 全国高等学校学生信息咨询与就业指导中心 |
| 31 | 清华大学 | 89 | 教育部基础教育课程教材发展中心 |
| 32 | 北京科技大学 | 90 | 全国学生资助管理中心 |
| 33 | 北京化工大学 | 91 | 中国教育学会 |
| 34 | 天津大学 | 92 | 中国高等教育学会 |
| 35 | 北京中医药大学 | 93 | 中国教育科学研究院 |
| 36 | 大连理工大学 | 94 | 教育部职业技术教育中心研究所 |
| 37 | 东北大学 | 95 | 教育部教育发展研究中心 |
| 38 | 西南大学 | 96 | 教育部科技发展中心 |
| 39 | 陕西师范大学 | 97 | 教育部高等学校社会科学发展研究中心 |
| 40 | 华中师范大学 | 98 | 教育部教育装备研究与发展中心 |
| 41 | 华东师范大学 | 99 | 全国高校古籍整理研究工作委员会 |
| 42 | 北京师范大学 | 100 | 教育部留学服务中心 |
| 43 | 东北师范大学 | 101 | 教育部考试中心 |
| 44 | 上海外国语大学 | 102 | 中国成人教育协会 |
| 45 | 北京外国语大学 | 103 | 中国职业技术教育学会 |
| 46 | 北京语言大学 | 104 | 中国教师发展基金会 |
| 47 | 西北农林科技大学 | 105 | 中国中学生体育协会 |
| 48 | 中国石油大学（北京） | 106 | 中国大学生体育协会 |
| 49 | 中国石油大学（华东） | 107 | 教育部学位与研究生教育发展中心 |
| 50 | 北京邮电大学 | 108 | 教育部高等教育教学评估中心 |
| 51 | 中国农业大学 | 109 | 中国教育发展基金会 |
| 52 | 北京林业大学 | 110 | 教育部经费监管事务中心 |
| 53 | 中国传媒大学 | 111 | 教育部民族教育发展中心 |
| 54 | 中央财经大学 | 112 | 中国教育报刊社 |
| 55 | 中国政法大学 | 113 | 教育部学校规划建设发展中心 |
| 56 | 中央音乐学院 | 114 | 教育部中外人文交流中心 |
| 57 | 中央美术学院 | 115 | 课程教材研究所 |
| 58 | 中央戏剧学院 |
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