全球植物基因测序计划是90年代初期提出的植物生物学国际性研究计划，计划实施始于1996年，由美国国家科学基金会(NSF)发起并总协调，美国国家能源部和农业部共同支持。全球主要的植物基因中心与美国NSF达成广泛的国际合作意向，欧盟、法国和日本也参与资助相关的项目。现在，该计划吸引了全球2500个博物馆8000多名科学家参与，应用新的工具对全球植物进行基因测序。
为了便于计划开展，研究人员应用和研制了一系列工具和方法：基因脱氧核糖核酸序列测试仪、植物变种的集合、转换植物基因的特殊技术、基于最新技术的生物信息工具、基因图谱。借助这些工具、技术和方法，科学家完成了植物基因的获取、完成了基因测序、获得了许多基因的功能、更好了理解了植物的行为。
在全球植物基因测序计划基本完成后，NSF开始了下一阶段植物基因测序计划的工作，计划在未来十年内，即2010年前，完成2500个植物基因的功能工作。主要热点工作包括：疾病防治、了解图像敏感性、生产健康的食用油、生产可降解塑料、生产更便宜的水果和蔬菜、促进防腐、理解植物开花过程等。
植物基因功能图谱网址：http://www.nsf.gov/od/lpa/news/media/2000/fsarabidopsis.htm
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