地球生物基因组计划(EBP)

2019年10月30日19:19:49地球生物基因组计划(EBP)已关闭评论5,260 views 952字阅读3分10秒

“地球生物基因组计划(Earth BioGenome Project, 以下简称“EBP”)”是继人类基因组计划后又一个大型国际计划,目标是在10年内,对约150万种已知真核生物进行测序和序列注释,该计划由加州大学戴维斯分校的科学家于20172月发出倡议,获得了美国、英国、挪威、巴西、中国等多个国家的科学家积极响应。2018423日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)刊登了EBP计划的主题文章,从开展背景、目标、预期成果、发展路线、机遇与挑战、协调管理机制、经费支出与经济效益等几个方面全面介绍了该计划的实施细节。该文章的发表预示着EBP计划的正式启动。

据物理学家组织网报道,科学家2018年11月1日在英国伦敦正式启动了一个庞大的全球性项目——地球生物基因组计划(EBP),准备在10年内对地球上所有150万种已知真核生物的基因组进行测序、编目和分类,预计耗资47亿美元。

科学家称,地球生物基因组计划是继人类基因组计划(HGP)之后的“下一个生物学登月计划”。人类基因组计划历时13年,耗资30亿美元(按现在的价格约为50亿美元),于2003年完成了对人类DNA图谱的绘制。地球生物基因组计划负责人、美国加州大学教授哈里斯·卢因说,预计该项目“最终将为推进保护生物多样性和维持人类社会可持续发展创造一个新基础”。

迄今为止,人类只完成了不到3500个(仅占0.2%)复杂生命物种的基因组测序,而测序结果中只有不到100个达到了可供查阅和学习的“参考质量”水平。地球生物基因组计划有望增加上百万个达到“参考质量”的基因组测序结果。科学家说,这将彻底改变人类对生物学和进化的认识,推动自然保护工作。

目前,来自美、英、中等国的17家机构签署了一份谅解备忘录,承诺将共同努力实现项目的最终目标。该项目拟收集生物的数据量有望达到“百亿亿级”(exascale),超过推特或整个天文学的数据量。项目参与方已同意将数据存储在公共数据库中,所有人都可以访问以进行研究。

该计划还将把世界各地的一些大型研究工作纳入其中,包括由洛克菲勒大学研究人员牵头、旨在对全部6.6万种脊椎动物遗传密码进行测序的项目,中国开展的一个旨在对1万种植物基因组进行测序的项目,以及对约200种蚂蚁的基因组进行测序的全球蚂蚁基因组联盟项目等。

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